GENOMICS UA | Геноміка ЮА

Tag: single-cell-course

  • Захист курсових проєктів з біології поодиноких клітин та просторової біології!

    Захист курсових проєктів з біології поодиноких клітин та просторової біології!

    Запрошуємо на відкритий захист командних курсових проєктів курсу Геноміки ЮА з біології поодиноких клітин та просторової біології!

    Під час зустрічі учасники курсу презентують мету аналізу наборів даних, хід аналізу, знахідки та їх інтерпретації. Наприкінці кожної презентації інструктори та відвідувачі зможуть ставити учасникам запитання.

    Теми курсових проєктів, представлених на захист, наступні:
    К1 (“Арррр”) – Spatially resolved cell types and signatures in INPP5D-deficient Alzheimer’s mice
    К2 – Просторова транскриптоміка в контексті біомедичних досліджень: методи stemness, Xenium, Merfish та Visium
    К3 – Функціональна гетерогенність фібробластів у шкірі людини: одноклітинний транскриптомний аналіз та вікові зміни
    К4 – Differential gene expression in single cells between preclinical and clinical stages of Alzheimer’s disease.
    К5 – Аналіз даних секвенування РНК поодиноких клітин гліобластоми людини
    К6 – Single-Cell Transcriptomic Analysis of Hematopoietic Stem and Progenitor Cells in Acute Myeloid Leukemia and Chemotherapy Response
    К7 – Дослідження змін, спричинених опроміненням
    К8 – Просторовий аналіз клітин у багатоканальних зображеннях: сегментація та оцінка експресії маркерів
    К9 – Вплив перебування в космосі на клітини мозку: аналіз за допомогою просторової транскриптоміки

    Розклад: в зображенні новини.
    Коли: 2025-04-23 та 2025-04-27, початок о 19:00 (київський час)
    Посилання: 2025-04-23 (https://youtube.com/live/tgIMlGe7_3k) та 2025-04-27 (https://youtube.com/live/J1BRSe4vrN0)

  • Фінал курсу з RNA-seq 2023

    Фінал курсу з RNA-seq 2023

    Починається останній тиждень нашого курсу, де учасники будуть презентувати результати аналізу даних секвенування РНК. Як того набору даних, який ми аналізували разом (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE205555), так і тих, що відібрали учасники самостійно. Ми переконані, що ці навички допоможуть у пошуку роботи й для наукових проєктів. Разом з тим, ми відкрили доступ до платформи тестування, і перший учасник вже отримав сертифікат. Вітаємо Святослава!

    За останній місяць ми переробили сайт і перенесли його на окремий сервер, а разом з тим впровадили GenomicsID. Це – єдиний логін на наші чинні та майбутні сервіси, які ми будемо додавати та розробляти. Наразі це ними є пошта на @genomics.org.ua та платформа для тестування. Якщо раптом комусь з учасників спільноти потрібна така адреса пошти для професійних цілей, можемо надати доступ в обмін на пожертву фонду “Повернись живим”. За бажанням, відправляйте скриншот свіжого донату разом зі своїм ім’ям на hello@genomics.org.ua

    подивитися запис
  • Training course in single-cell biology

    Training course in single-cell biology

    Single-cell analysis is an extremely powerful tool to discover biological processes due to its high resolution and wide range of possibilities. So we decided to organize a short but in-depth course in this field. We would like to invite you to our practical course in single-cell biology to become familiar with core single-cell analysis methods.
    This course is a series of online events that highlight the theoretical basics of single-cell analysis. The program covers sample preparation, data processing, and workshops on different pipelines, including scRNAseq, scATACseq, TCR/BCR sequencing, CITEseq, and much more.

    Meeting days are:

    • Sunday, 4.04.2021
    • Monday, 5.04.2021
    • Wednesday, 7.04.2021
    • Friday, 9.04.2021
    • Saturday, 10.04.2021

    Each meeting starts at 18.00 CET and will take approximately 2-3 hours. The format of the event is Zoom-meeting with breakout-rooms if needed. All participants will be supplied with individual tasks, study materials, and instructions for hands-on sessions.

    Speakers:

    • Vladyslav Kavaka, MD candidate, LMU Munich
    • Maryna Korshevniuk, PhD Candidate, UMCG
    • Oleksandr Petrenko, Predoctoral Fellow, LBI-RUD / CeMM
    • Yuliya Syntikova, PhD, LifeMine Therapeutics

    Requirements:

    • Basic knowledge in cell and molecular biology;
    • Basic skills in R programming language;
    • No prior knowledge of single-cell analysis is required.

    Language: English

    Registration:
    To register for the course in single-cell biology, please complete the following form: https://forms.gle/H3zXb1ofaSvZ3bKg8
    The deadline for registration is 31.03.2021.
    Detailed programs will be announced one week before the event. All participants will receive the mail with further instructions and study materials.

    подивитися запис