Tag: Спільнота

  • ATAC-me і перепрограмування клітин

    ATAC-me і перепрограмування клітин

    Biomedical Journal Club – це проєкт громадської організації “Геноміка ЮА”. Під час журнального клубу один учасник доповідає про обрану наукову статтю, а слухачі можуть ставити запитання. Після презентації відбувається неформальне спілкування та нетворкінг.

    + На цій зустрічі ми обговоримо статтю:
    Barnett K.R. et al. ATAC-Me Captures Prolonged DNA Methylation of Dynamic Chromatin Accessibility Loci during Cell Fate Transitions
    https://www.cell.com/molec…/fulltext/S1097-2765(20)30004-6
    + Доповідач: Іван Берест, PhD студент в European Molecular Biology Laboratory, біоінформатик (https://twitter.com/jambocurious).
    + Коли: 22 квітня 2020 о 19:00 (київський час).
    + Де: онлайн. Ми робимо дзвінок-конференцію в Zoom, до якого може приєднатися кожен. Там доповідач транслює презентацію, можна ставити питання та брати участь у дискусії. Якщо в вас немає змоги приєднатися через Zoom, ми робимо трансляцію (крім неформальної частини та нетворкінгу) на нашому YouTube-каналі.
    Zoom: https://us02web.zoom.us/j/84990970614… | Meeting ID: 849 9097 0614 | Password: genomicsua
    YouTube: https://youtu.be/Jc0g3EuXSBU

    FAQ:
    — Що таке журнальний клуб?
    — Це формат, який працює в багатьох інститутах та лабораторіях по всьому світу: доповідач презентує статтю та додаткову інформацію, необхідну для її розуміння, аналізує експериментальну частину, переваги та недоліки. Після цього учасники зустрічі оговорюють статтю. Взагалі, це гарний спосіб навчитися новому, дізнатися про інші напрями, познайомитися з новими людьми.

    — Як мені підготуватися для зустрічі?
    — Дуже рекомендується прочитати саму статтю та подивитися ілюстрації. Це допоможе визначити запитання та теми для дискусії. Якщо тема для вас є новою чи складною, рекомендовано ознайомитися з базовими поняттями. Якщо вам потрібна рекомендація, що прочитати на певну тему, запитайте нас!

    — Як мені приєднатися та ставити запитання?
    — Вам потрібно зареєструватися на zoom.com (це безкоштовно), звантажити програму, перейти по посиланню, яке надане в анонсі події та ввести приведений пароль. Чи просто ввести meeting ID та пароль, якщо ви вже встановили та відкрили програму. Якщо є змога, приєднуйтесь з веб-камерою, це допомагає створити ефект присутності задля більш неформального спілкування. Зазвичай учасники виключають мікрофон (“mute”), доки спілкується хтось інший. Якщо в вас виникли запитання до завершення доповіді, ви можете надіслати їх в чат, чи запитати через мікрофон. Якщо ви дивитесь нас через YouTube, ви можете залишати запитання в чаті трансляції.

    — Мені сподобалось / є запитання / хочу бути на зв’язку з вами.
    — Перш за все, дякуємо за вашу зацікавленість! Ми зібрали біомедичну спільноту в Telegram і ви можете приєднатися. Перейдіть на канал https://t.me/GenomicsUA, підпишіться і в описі ви знайдете посилання на чат.
    Не забудьте підписатися на нашу сторінку Facebook:
    https://www.facebook.com/GenomicsUA
    На наш YouTube-канал:
    https://www.youtube.com/ngogenomicsua
    Та на локальне представництво організації:
    Київ: https://www.facebook.com/kyivbioinformatics/
    Одеса: https://www.facebook.com/odesabioinformatics/
    В разі запитань, зв’яжіться з нами будь-яким з цих способів.

  • Волонтерський реєстр фахівців для ПЛР-діагностики на COVID-19

    Волонтерський реєстр фахівців для ПЛР-діагностики на COVID-19

    Пандемія COVID-2019 кидає виклик суспільству і ми, як громадська організація, яка займається розвитком біомедичних наук та має сформовану спільноту фахівців, не можемо не залучитися до боротьби.

    Ми направили запит до Центр громадського здоров’я України й отримали відповідь (https://bit.ly/3cId0nK), що в Україні є дефіцит підготовлених фахівців, які могли б залучитися до ПЛР-тестування зразків на COVID-19. Тому ми закликаємо приєднатися до нашого реєстру. За потреби, ЦГЗ буде контактувати з фахівцями з реєстру щодо їх можливого залучення до тестування.

    Якщо ви маєте навички для проведення ПЛР-тестування зразків та бажаєте допомогти в боротьбі з COVID-19, заповніть, будь ласка, наступну форму: https://bit.ly/351l9B7

    Сформований реєстр буде переданий до Центру громадського здоров’я Міністерства охорони здоров’я України.

    Є запитання? Напишіть нам на сторінку або зв’яжіться з нами поштою: i@genomics.org.ua

    Просимо наших колег та друзів підтримати цю кампанію, поділившись дописом.
    📝приватне повідомлення для GenomicsUA на Facebook
    📝у чат в Telegram
    📝на електронну пошту i@genomics.org.ua

    P.S. Можете поділитися з друзями та колегами 🙂

    Ваша команда GenomicsUA ❤️🧬

  • Бактеріальні нуклеотиди та метод рідинної хроматографії

    Бактеріальні нуклеотиди та метод рідинної хроматографії

    Відкриті лекції від ГО “Геноміка ЮА” — це формат, в якому запрошені фахівці розповідають про свій проєкт, чи про науковий напрям, а слухачі можуть ставити запитання. Після презентації відбувається неформальне спілкування та нетворкінг.

    + Темою цієї лекції стане вивчення бактеріальних нуклеотидів за допомогою методу високоефективної рідинної хроматографії (ВРХ). На зустрічі лекторка представить статтю про застосування методу ВРХ в сучасних наукових дослідженнях та розповість про базові принципи роботи з хроматографом.
    Посилання на статтю:
    https://www.nature.com/articles/s41598-017-10988-6
    + Доповідачка: Tatyana Brodiazhenko, PhD-студентка в University of Tartu (Estonia) і assistant researcher в Umeå University (Sweden).
    + Коли: 30.04.2020 о 19:00 (за київським часом).
    + Де: онлайн. Ми робимо дзвінок-конференцію в Zoom, до якого може приєднатися кожен. Там доповідач транслює презентацію, можна ставити питання та брати участь у дискусії. Якщо в вас немає змоги приєднатися через Zoom, ми робимо трансляцію (крім неформальної частини та нетворкінгу) на нашому YouTube-каналі.
    Zoom: Meeting ID: 828 8853 5621, Password: genomicsua
    https://us02web.zoom.us/j/82888535621?pwd=S1BSMmxLK1F0UHFzRGEzMUhBajFnUT09
    YouTube: https://youtu.be/A3N1lkSQV4I

    FAQ:
    — Як мені приєднатися та ставити запитання?
    — Вам потрібно зареєструватися на zoom.com (це безкоштовно), звантажити програму, перейти по посиланню, яке надане в анонсі події та ввести приведений пароль. Чи просто ввести meeting ID та пароль, якщо ви вже встановили та відкрили програму. Якщо є змога, приєднуйтесь з веб-камерою, це допомагає створити ефект присутності задля більш неформального спілкування. Зазвичай учасники виключають мікрофон (“mute”), доки спілкується хтось інший. Якщо в вас виникли запитання до завершення доповіді, ви можете надіслати їх в чат, чи запитати через мікрофон. Якщо ви дивитесь нас через YouTube, ви можете залишати запитання в чаті трансляції.— Мені сподобалось / є запитання / хочу бути на зв’язку з вами.
    — Перш за все, дякуємо за вашу зацікавленість! Ми зібрали біомедичну спільноту в Telegram і ви можете приєднатися. Перейдіть на канал https://t.me/GenomicsUA, підпишіться і в описі ви знайдете посилання на чат.
    Не забудьте підписатися на наші сторінки Facebook:
    https://www.facebook.com/GenomicsUA
    https://www.facebook.com/BioinformaticsUA
    На наш YouTube-канал:
    https://www.youtube.com/ngogenomicsua
    В разі запитань, зв’яжіться з нами будь-яким з цих способів.

  • Вакансія Field Application Scientist in Next Generation Sequencing

    Вакансія Field Application Scientist in Next Generation Sequencing

    Наші друзі з BioLabTech шукають спеціаліста на позицію Field Application Scientist in Next Generation Sequencing.

    Навіть якщо ви не підходите на 100% під вимоги, проте вважаєте себе гарним кандидатом, зв’яжіться з компанією, бо є можливості інтенсивної освітньої програми.

    Для зв’язку та надсилання резюме: hr@biolabtech.com.ua

    Вимоги до кандидата:

    PhD в біології, спеціалізація в генетичних дослідженнях. Досвід наукової та практичної роботи в лабораторії від 5 років. Глибокий рівень знань методів молекулярної біології, генетики. Гарні комунікативні якості. Здатність швидко навчатися та набувати нових практичних навичок. Здатність проведення ефективних презентацій перед аудиторією. Вміння навчати як теоретично, так і на практиці. Знання англійської мови не нижче B2.

    Обовязки:

    • Консультування клієнтів з питань, що стосуються технології і продуктів для NGS
    • Інсталяція приладів для NGS та проведення навчання користувачів систем для секвенування повному робочому процесу від пробопідготовки до аналізу результатів
    • Консультативна підтримка користувачів систем для секвенування
    • Допомога користувачам у вирішенні проблемних ситуацій
    • Проведення семінарів, демонстраційних сесій, участь у конференціях

    Компанія «Біолабтех» забезпечує умови для росту кваліфікації персоналу завдяки участі у тренінгах, школах.

  • Introduction to single-cell sequencing

    Introduction to single-cell sequencing

    We want to invite you to visit open lectures “Introduction to single-cell sequencing” of the Kyiv Bioinformatics Club.
    During the two meetings, we will talk about how the single-cell technologies were invented, how they were evolved and how to determine the DNA / RNA sequences of each individual cell.

    Lecturer: Maryna Korshevniuk, a student at the Max Delbrück Center for Molecular Medicine in the Helmholtz Association.
    Her interests: single-cell technologies, multi-omics.

    When: February 10th and 11th, 2020 from 7:00 PM
    Where: Bohomolets Institute of Physiology, Main Building, Second Floor, room 212.
    Address: 4, Bogomolets Street, Kyiv

    IMPORTANT UPDATE: All lectures will be conducted in English.

  • Трансляційні дослідження

    Трансляційні дослідження

    Запрошуємо вас відвідати відкриту лекцію “Трансляційні дослідження: scientia vincere morbum” від організації Genomics UA.
    Від першої стрічки коду, від першого натискання піпеткою до нового лікування певної хвороби — саме в цьому полягає сила трансляційних досліджень. На лекції ми обговоримо:
    І) що таке трансляційні дослідження;
    ІІ) приклади, коли вони призвели до позитивних наслідків для пацієнтів та для суспільства;
    ІІІ) хто працює над ними та чим ці люди займаються;
    ІV) які кар’єрні можливості існують в цьому напрямі.

    Для кого: в лекції буде використовуватися наукова термінологія, яка знайома студентам та спеціалістам біомедичних напрямів, проте лекція орієнтована на широку аудиторію і буде зрозуміла всім, хто цікавиться чи працює у life sciences.
    Лектор: Oleksandr Petrenko, лікар, PhD-студент в Ludwig Boltzmann Institute for Rare and Undiagnosed Diseases та Predoctoral Fellow у CeMM (Research Center for Molecular Medicine of the Austrian Academy of Sciences), співзасновник громадської організації “Геноміка ЮА”, автор блогу mutation.me – biomedicine 4U.

    Коли: 14 лютого, 17:00 – 19:00.
    Де: Одеська обласна універсальна наукова бібліотека ім. М.Грушевського, другий поверх. https://goo.gl/maps/oRJXC6KSpuauGnG28.
    Вхід: безкоштовний.

    Оригінал зображення: “Metastatic Melanoma Cells”, Julio C. Valencia, NCI Center for Cancer Research, ліцензія CC BY-NC 2.0

  • Зустріч з нанопорного секвенування

    Зустріч з нанопорного секвенування

    Запрошуємо Вас на зустріч Київського біоінформатичного клубу.
    Де: пр. Перемоги, 37, бібліотека КПІ, зала 1.2
    Коли: 8 лютого, о 12:00.

    План заходу:
    1. Оглядова лекція про технологію нанопорного секвенування, прилади сімейства Oxford Nanopore, плюси та мінуси секвенування третього покоління.
    Лектор: Dmytro Kazanzhy, дата-аналітик.

    2. Кейс аналізу даних нанопорного секвенування з використанням хмарних сервісів (Google Cloud Platform).
    Проект стосувався визначення мікроорганізмів та їх асоціації, що викликають сепсис у реанімаційних хворих.
    Лектор: Severyn Parkhomenko, інженер-програміст, data scientist в The APP Solutions.

    3. Нетворкінг
    Ми б дуже хотіли, щоб кожен з вас поділився своїми вміннями та інтересами. Це допоможе знайти однодумців для майбутніх проектів. Кожному надається 3-5 хвилин для розповіді + 2 хвилини на запитання аудиторії. Можна з презентацією.
    Лектор – кожен з Вас.

  • Ландшафт поодиноких клітин при патології раку молочної залози

    Ландшафт поодиноких клітин при патології раку молочної залози

    На зустрічі біомедичного журнального клубу ми обговоримо статтю:
    𝗧𝗵𝗲 𝘀𝗶𝗻𝗴𝗹𝗲-𝗰𝗲𝗹𝗹 𝗽𝗮𝘁𝗵𝗼𝗹𝗼𝗴𝘆 𝗹𝗮𝗻𝗱𝘀𝗰𝗮𝗽𝗲 𝗼𝗳 𝗯𝗿𝗲𝗮𝘀𝘁 𝗰𝗮𝗻𝗰𝗲𝗿
    (https://www.nature.com/articles/s41586-019-1876-x)

    Презентацію по статті підготовить Maryna Korshevniuk – студентка в Max Delbrück Center for Molecular Medicine in the Helmholtz Association. В сферу інтересів лекторки входить 𝘚𝘪𝘯𝘨𝘭𝘦-𝘤𝘦𝘭𝘭 𝘵𝘦𝘤𝘩𝘯𝘰𝘭𝘰𝘨𝘪𝘦𝘴 та мультиоміка.

    Коли: 2 лютого 2020 о 20:00
    Де: online, https://www.youtube.com/watch?v=9_qzQ7uuTQ0

  • Вакансія Principal Investigator

    Вакансія Principal Investigator

    Вакансія від Research Center for Molecular Medicine of the Austrian Academy of Sciences (CeMM).

    Якщо ви дослідник зі ступенем MD та/або PhD, зверніть увагу: CeMM шукає мотивованих кандидатів на позицію Starting Principal Investigator.
    Деталі за посиланням:

    Лінк

  • Повногеномний пошук асоціацій (GWAS) поведінкових ознак

    Повногеномний пошук асоціацій (GWAS) поведінкових ознак

    UPD: Щойно ми відкрили доступ до запису зустрічі.

    У разі запитань чи уточнень щодо доповіді, ви можете звернутися безпосередньо до лекторів (Олександр Шинкаренко та Валерія Телиженко), або написати коментар у соціальних мережах.

    Приєднуйтесь до нас, щоб взяти участь у наступній зустрічі журнального клубу чи запропонувати наукову публікацію для огляду.
    https://www.facebook.com/GenomicsUA/
    https://www.t.me/GenomicsUA/

    Анонс події

    На черговій зустрічі біомедичного журнального клубу обговоримо Полногеномний пошук асоціацій (GWAS) поведінкових ознак на прикладі статті “Large-scale GWAS reveals insights into the genetic architecture of same-sex sexual behavior“.
    Доповідачі: Alexander Shynkarenko та Valeria Telizhenko.

    Посилання на трансляцію буде опубліковано в телеграм-каналі GenomicsUA

    Матеріали для підготовки:

    Посилання на подію в ФБ.