Tag: Спільнота

У вересні відбулись два семінара по введенню в машинне навчання від Jenya Sidyakin та про основи бібліотеки Pandas від Dmytro Kazanzhy.

Лекція Rostyslav Kuzyakiv (clinical data scientist в Zurich Hospital) про те що як обробляти біомедичні дані.

Вебінар присвячений biomedical data life cycle management, про те які виклики зараз стоять перед аналітиками біомедичних даних та які є доступні open source рішення.
Ця тема напряму пов’язана з біологами, медиками та усіма хто залучений у сучасні наукові проєкти. В презентації буде висвітлений досвід роботи у наукових дослідженнях з боку BioMed Data Life Cycle.
Прикладом для кращого висвітлення теми буде портал Університету Цюриха для Data management, аналізу і візуалізації.
А наприкінці трохи про самоосвіту в Data management та Bioinformatics data analysis, найпоширеніші інструменти та методики.

Приємного перегляду!

Біоінформатика існує, щоб знаходити відповіді на біологічні питання, котрі неможливо розв’язати лабораторними методами. Одне з таких питань — точне визначення фенотипових різниць у біологічних зразках. Як виокремити пацієнтів, котрим допоможуть нові ліки? Як клітини реагують на подразник або на гормон? Які метаболічні шляхи активуються при загоєнні ран?

Відповідями на ці питання займається транскриптоміка та її базові методи: Differential Gene Expression та Gene Set Enrichment Analysis. Цими методами ми можемо отримати різницю між обраними фенотипами за результатами їх РНК-секвенування. На лекції ви зможете більше дізнатися про те, як правильно аналізувати дані генної експресії для визначення диференційної експресії.

Лектор: Олександр Шинкаренко, співзасновник HTuO Biosciences, співзасновник Genomics UA.
Дата: 26.12.2020
Час: 20:00 (по Києву)
Де: Zoom (https://us02web.zoom.us/j/83799185308?pwd=RDVYekcyK1paZUpkTkpMRVlqc29odz09)

Там ми розповіли аудиторії лікарів та медичних менеджерів про біоінформатику у світі та в Україні. Показали, як біоінформатика використовується у клінічній діагностиці та наукових дослідженнях рідкісних хвороб. 💊

Надзвичайно приємно бачити, що ця тема привертає все більше інтересу в Україні! Будемо ради використати компетенцію команди ГО “Геноміка ЮА” та залучити нашу спільноту у разі спільних проєктів з медичними установами. 🧪

Дякуємо учасникам заходу за участь та організаторам за запрошення! 🧬

Світ змінюється, а разом з ним змінюємося й ми!

Ми розпочинали діяльність “Геноміки” ще у 2018-му. Нашим першим заходом був воркшоп з диференційної експресії генів🧬, який в Одесі провела Юлія Ситнікова. Після цього заходу розпочав працювати одеський клуб біоінформатики, а згодом був заснований і київський.

Аби наші зустрічі були безпечними😷, під час пандемії ми зустрічалися виключно онлайн. Такий формат згуртував нашу спільноту ще сильніше, а також дозволив знайти нових колег, які зараз працюють не в Україні. Ми вирішили сконцентруватися саме на такому форматі й надалі. І хоча ми плануємо робити офлайн зустрічі, коли це буде безпечно, ми вирішили не локалізовувати наші клуби, а розширити географію і бути глобальними!🌍

Тому відсьогодні ми об’єднуємо проєкти Odesa Bioinforamtics Club та Kyiv Bioinformatics Club у новий — Bioinformatics UA. Подальше спілкування з обох проєктів буде тут: t.me/bioinformaticsua (колишній чат київського клубу).

Дякуємо, що ви з нами🤩. Сьогодні разом ми робимо найбільшу українську спільноту з біоінформатики, системної біології та пов’язаних напрямів.

The topic of the lecture: From patients to genetics – paralyzing struggles of translating ALS
Speaker: Sophie Imhof, PhD Student at the Medical University of Vienna, Department of Neurology, author of a blog for science communication: https://www.instagram.com/sophie_imhof/
When: 05.06.2020 at 18:00 (Vienna time) | 19:00 (Kyiv time).
Where: Online. We invite you to connect via Zoom to participate in the discussion after the lecture, or to join the YouTube translation. The access links will be provided after free registration: https://www.eventbrite.com/e/105936210056

Open lectures of the NGO “Genomics UA” ​​is a non-formal education format in which invited experts talk about their projects or research field. After a presentation, we organize a Q&A session with the speaker and provide an opportunity for informal communication and networking.

Amyotrophic lateral sclerosis is a fast progressing and lethal neurodegenerative disease that predominantly affects the upper and lower motor neurons. To this point, there is no cure for this pathology and patients have a life expectancy of 3 months to 5 years. Only 10% of cases are due to genetic and hereditary reasons (familial ALS), leaving 90% of patients in the dark of the underlying mechanism of their pathology (sporadic ALS). Only two FDA approved compounds, Riluzole, which prolongs life for up to 3 months, and Edaravone, which was shown to slow down disease progression, are used to treat ALS patients, however, they remain drugs of low efficiency. Out of this reason, researchers worldwide are establishing models and using state-of-the-art technology to investigate this disease. Although our community of ALS scientists and clinicians is eager to beat this pathology, we face many obstacles in the form of patient heterogeneity, different molecular phenotypes, and technical limitations. To overcome these burdens, I believe we need to change our mindset and perspective on this disease and step one step back to discover novel niches of research. Patient cohorts, genetics, iPSCs, stem cell therapy, vitamin supplements – what do we actually know about this disease and how can we pave a new path for effective treatment?

Additional information:
– How can I join and ask questions?
– You need to register on zoom.com (it’s free), download the program, go to the link provided in the event announcement, and enter the password. Or just enter the meeting ID and password if you have already installed and opened the program. If possible, join our meetings with a turned-on camera, it helps to create a presence effect for more informal communication. Participants usually turn off the microphone while someone else is talking. If you have questions before the end, feel free to send them to the chat. If you can not join us via Zoom, there is an alternative to join through the YouTube stream. If you watch us on YouTube, you can ask questions in the chat and our moderators will check them.

– I liked the event / I have more questions / I want to be in touch with you.
– First of all, thank you for your interest! We have put together a biomedical community in Telegram and you are invited to join. Go to the channel https://t.me/GenomicsUA, subscribe, and in the description, you will find a link to the chat. If you are not a Telegram user, feel free to drop your question to i@genomics.org.ua, or to our Facebook page.

Don’t forget to subscribe to our Facebook page:
https://www.facebook.com/GenomicsUA
To our YouTube channel:
https://www.youtube.com/ngogenomicsua
And to the local representative office of the organization:
Kyiv: https://www.facebook.com/kyivbioinformatics/
Odesa: https://www.facebook.com/odesabioinformatics/
If you have any questions, please contact us in any of these ways.

Приємного перегляду!

А ми до вас просто з пречудовими новинами!

Нам вдалося отримати фінансування від BioUkraine на участь у BIO Digital events!
Ми неймовірно цьому раді й, звичайно, сподіваємося на подальшу мегауспішну співпрацю!

На цьому івенті ми прослухаємо лекції, присвячені глобальним аспектам біотехнологій і бізнес-моделям. Будемо брати участь у зустрічах, темами яких будуть розробки препаратів, стартапи у секторі біотеху, питання рівності у цій же галузі, як зараз використовується штучний інтелект, machine learning і ще дуже багато всього цікавого!

Ви знаєте нас, як провідників біоінформатичного світла для всіх тих, хто його потребує, тому, неважко здогадатися, що всі знання, які ми отримаємо на раніше згаданій події, із величезним задоволенням передамо ВАМ!
Ми організуємо декілька лекцій, summary-зустріч, workshop — усе, що вам може бути корисно!

📌А ще ви можете переглянути програму івенту та повідомити, що саме вас найбільше зацікавило. Ми звернемо на це особливу увагу!

Написати нам можна
📝приватне повідомлення для GenomicsUA на Facebook
📝у чат в Telegram
📝на електронну пошту i@genomics.org.ua

P.S. Можете поділитися з друзями та колегами 🙂

Ваша команда GenomicsUA ❤️🧬

Пандемія COVID-2019 кидає виклик суспільству і ми, як громадська організація, яка займається розвитком біомедичних наук та має сформовану спільноту фахівців, не можемо не залучитися до боротьби.

Ми направили запит до Центр громадського здоров’я України й отримали відповідь (https://bit.ly/3cId0nK), що в Україні є дефіцит підготовлених фахівців, які могли б залучитися до ПЛР-тестування зразків на COVID-19. Тому ми закликаємо приєднатися до нашого реєстру. За потреби, ЦГЗ буде контактувати з фахівцями з реєстру щодо їх можливого залучення до тестування.

Якщо ви маєте навички для проведення ПЛР-тестування зразків та бажаєте допомогти в боротьбі з COVID-19, заповніть, будь ласка, наступну форму: https://bit.ly/351l9B7

Сформований реєстр буде переданий до Центру громадського здоров’я Міністерства охорони здоров’я України.

Є запитання? Напишіть нам на сторінку або зв’яжіться з нами поштою: i@genomics.org.ua

Просимо наших колег та друзів підтримати цю кампанію, поділившись дописом.
📝приватне повідомлення для GenomicsUA на Facebook
📝у чат в Telegram
📝на електронну пошту i@genomics.org.ua

P.S. Можете поділитися з друзями та колегами 🙂

Ваша команда GenomicsUA ❤️🧬