Tag: Спільнота

  • Об’єднання Kyiv Bioinformatics Club та Odesa Bioinformatics Club

    Об’єднання Kyiv Bioinformatics Club та Odesa Bioinformatics Club

    Світ змінюється, а разом з ним змінюємося й ми!

    Ми розпочинали діяльність “Геноміки” ще у 2018-му. Нашим першим заходом був воркшоп з диференційної експресії генів🧬, який в Одесі провела Юлія Ситнікова. Після цього заходу розпочав працювати одеський клуб біоінформатики, а згодом був заснований і київський.

    Аби наші зустрічі були безпечними😷, під час пандемії ми зустрічалися виключно онлайн. Такий формат згуртував нашу спільноту ще сильніше, а також дозволив знайти нових колег, які зараз працюють не в Україні. Ми вирішили сконцентруватися саме на такому форматі й надалі. І хоча ми плануємо робити офлайн зустрічі, коли це буде безпечно, ми вирішили не локалізовувати наші клуби, а розширити географію і бути глобальними!🌍

    Тому відсьогодні ми об’єднуємо проєкти Odesa Bioinforamtics Club та Kyiv Bioinformatics Club у новий — Bioinformatics UA. Подальше спілкування з обох проєктів буде тут: t.me/bioinformaticsua (колишній чат київського клубу).

    Дякуємо, що ви з нами🤩. Сьогодні разом ми робимо найбільшу українську спільноту з біоінформатики, системної біології та пов’язаних напрямів.

  • Lecture: From patients to genetics – paralyzing struggles of translating ALS by Sophie Imhof

    Lecture: From patients to genetics – paralyzing struggles of translating ALS by Sophie Imhof

    The topic of the lecture: From patients to genetics – paralyzing struggles of translating ALS
    Speaker: Sophie Imhof, PhD Student at the Medical University of Vienna, Department of Neurology, author of a blog for science communication: https://www.instagram.com/sophie_imhof/
    When: 05.06.2020 at 18:00 (Vienna time) | 19:00 (Kyiv time).
    Where: Online. We invite you to connect via Zoom to participate in the discussion after the lecture, or to join the YouTube translation. The access links will be provided after free registration: https://www.eventbrite.com/e/105936210056

    Open lectures of the NGO “Genomics UA” ​​is a non-formal education format in which invited experts talk about their projects or research field. After a presentation, we organize a Q&A session with the speaker and provide an opportunity for informal communication and networking.

    Amyotrophic lateral sclerosis is a fast progressing and lethal neurodegenerative disease that predominantly affects the upper and lower motor neurons. To this point, there is no cure for this pathology and patients have a life expectancy of 3 months to 5 years. Only 10% of cases are due to genetic and hereditary reasons (familial ALS), leaving 90% of patients in the dark of the underlying mechanism of their pathology (sporadic ALS). Only two FDA approved compounds, Riluzole, which prolongs life for up to 3 months, and Edaravone, which was shown to slow down disease progression, are used to treat ALS patients, however, they remain drugs of low efficiency. Out of this reason, researchers worldwide are establishing models and using state-of-the-art technology to investigate this disease. Although our community of ALS scientists and clinicians is eager to beat this pathology, we face many obstacles in the form of patient heterogeneity, different molecular phenotypes, and technical limitations. To overcome these burdens, I believe we need to change our mindset and perspective on this disease and step one step back to discover novel niches of research. Patient cohorts, genetics, iPSCs, stem cell therapy, vitamin supplements – what do we actually know about this disease and how can we pave a new path for effective treatment?

    Additional information:
    – How can I join and ask questions?
    – You need to register on zoom.com (it’s free), download the program, go to the link provided in the event announcement, and enter the password. Or just enter the meeting ID and password if you have already installed and opened the program. If possible, join our meetings with a turned-on camera, it helps to create a presence effect for more informal communication. Participants usually turn off the microphone while someone else is talking. If you have questions before the end, feel free to send them to the chat. If you can not join us via Zoom, there is an alternative to join through the YouTube stream. If you watch us on YouTube, you can ask questions in the chat and our moderators will check them.

    – I liked the event / I have more questions / I want to be in touch with you.
    – First of all, thank you for your interest! We have put together a biomedical community in Telegram and you are invited to join. Go to the channel https://t.me/GenomicsUA, subscribe, and in the description, you will find a link to the chat. If you are not a Telegram user, feel free to drop your question to i@genomics.org.ua, or to our Facebook page.

    Don’t forget to subscribe to our Facebook page:
    https://www.facebook.com/GenomicsUA
    To our YouTube channel:
    https://www.youtube.com/ngogenomicsua
    And to the local representative office of the organization:
    Kyiv: https://www.facebook.com/kyivbioinformatics/
    Odesa: https://www.facebook.com/odesabioinformatics/
    If you have any questions, please contact us in any of these ways.

    Приємного перегляду!

  • Genomics UA отримали фінансування на відвідання BIO Digital events!

    Genomics UA отримали фінансування на відвідання BIO Digital events!

    А ми до вас просто з пречудовими новинами!

    Нам вдалося отримати фінансування від BioUkraine на участь у BIO Digital events!
    Ми неймовірно цьому раді й, звичайно, сподіваємося на подальшу мегауспішну співпрацю!

    На цьому івенті ми прослухаємо лекції, присвячені глобальним аспектам біотехнологій і бізнес-моделям. Будемо брати участь у зустрічах, темами яких будуть розробки препаратів, стартапи у секторі біотеху, питання рівності у цій же галузі, як зараз використовується штучний інтелект, machine learning і ще дуже багато всього цікавого!

    Ви знаєте нас, як провідників біоінформатичного світла для всіх тих, хто його потребує, тому, неважко здогадатися, що всі знання, які ми отримаємо на раніше згаданій події, із величезним задоволенням передамо ВАМ!
    Ми організуємо декілька лекцій, summary-зустріч, workshop — усе, що вам може бути корисно!

    📌А ще ви можете переглянути програму івенту та повідомити, що саме вас найбільше зацікавило. Ми звернемо на це особливу увагу!

    Написати нам можна
    📝приватне повідомлення для GenomicsUA на Facebook
    📝у чат в Telegram
    📝на електронну пошту i@genomics.org.ua

    P.S. Можете поділитися з друзями та колегами 🙂

    Ваша команда GenomicsUA ❤️🧬

  • Волонтерський реєстр фахівців для ПЛР-діагностики на COVID-19

    Волонтерський реєстр фахівців для ПЛР-діагностики на COVID-19

    Пандемія COVID-2019 кидає виклик суспільству і ми, як громадська організація, яка займається розвитком біомедичних наук та має сформовану спільноту фахівців, не можемо не залучитися до боротьби.

    Ми направили запит до Центр громадського здоров’я України й отримали відповідь (https://bit.ly/3cId0nK), що в Україні є дефіцит підготовлених фахівців, які могли б залучитися до ПЛР-тестування зразків на COVID-19. Тому ми закликаємо приєднатися до нашого реєстру. За потреби, ЦГЗ буде контактувати з фахівцями з реєстру щодо їх можливого залучення до тестування.

    Якщо ви маєте навички для проведення ПЛР-тестування зразків та бажаєте допомогти в боротьбі з COVID-19, заповніть, будь ласка, наступну форму: https://bit.ly/351l9B7

    Сформований реєстр буде переданий до Центру громадського здоров’я Міністерства охорони здоров’я України.

    Є запитання? Напишіть нам на сторінку або зв’яжіться з нами поштою: i@genomics.org.ua

    Просимо наших колег та друзів підтримати цю кампанію, поділившись дописом.
    📝приватне повідомлення для GenomicsUA на Facebook
    📝у чат в Telegram
    📝на електронну пошту i@genomics.org.ua

    P.S. Можете поділитися з друзями та колегами 🙂

    Ваша команда GenomicsUA ❤️🧬

  • Бактеріальні нуклеотиди та метод рідинної хроматографії

    Бактеріальні нуклеотиди та метод рідинної хроматографії

    Відкриті лекції від ГО “Геноміка ЮА” — це формат, в якому запрошені фахівці розповідають про свій проєкт, чи про науковий напрям, а слухачі можуть ставити запитання. Після презентації відбувається неформальне спілкування та нетворкінг.

    + Темою цієї лекції стане вивчення бактеріальних нуклеотидів за допомогою методу високоефективної рідинної хроматографії (ВРХ). На зустрічі лекторка представить статтю про застосування методу ВРХ в сучасних наукових дослідженнях та розповість про базові принципи роботи з хроматографом.
    Посилання на статтю:
    https://www.nature.com/articles/s41598-017-10988-6
    + Доповідачка: Tatyana Brodiazhenko, PhD-студентка в University of Tartu (Estonia) і assistant researcher в Umeå University (Sweden).
    + Коли: 30.04.2020 о 19:00 (за київським часом).
    + Де: онлайн. Ми робимо дзвінок-конференцію в Zoom, до якого може приєднатися кожен. Там доповідач транслює презентацію, можна ставити питання та брати участь у дискусії. Якщо в вас немає змоги приєднатися через Zoom, ми робимо трансляцію (крім неформальної частини та нетворкінгу) на нашому YouTube-каналі.
    Zoom: Meeting ID: 828 8853 5621, Password: genomicsua
    https://us02web.zoom.us/j/82888535621?pwd=S1BSMmxLK1F0UHFzRGEzMUhBajFnUT09
    YouTube: https://youtu.be/A3N1lkSQV4I

    FAQ:
    — Як мені приєднатися та ставити запитання?
    — Вам потрібно зареєструватися на zoom.com (це безкоштовно), звантажити програму, перейти по посиланню, яке надане в анонсі події та ввести приведений пароль. Чи просто ввести meeting ID та пароль, якщо ви вже встановили та відкрили програму. Якщо є змога, приєднуйтесь з веб-камерою, це допомагає створити ефект присутності задля більш неформального спілкування. Зазвичай учасники виключають мікрофон (“mute”), доки спілкується хтось інший. Якщо в вас виникли запитання до завершення доповіді, ви можете надіслати їх в чат, чи запитати через мікрофон. Якщо ви дивитесь нас через YouTube, ви можете залишати запитання в чаті трансляції.— Мені сподобалось / є запитання / хочу бути на зв’язку з вами.
    — Перш за все, дякуємо за вашу зацікавленість! Ми зібрали біомедичну спільноту в Telegram і ви можете приєднатися. Перейдіть на канал https://t.me/GenomicsUA, підпишіться і в описі ви знайдете посилання на чат.
    Не забудьте підписатися на наші сторінки Facebook:
    https://www.facebook.com/GenomicsUA
    https://www.facebook.com/BioinformaticsUA
    На наш YouTube-канал:
    https://www.youtube.com/ngogenomicsua
    В разі запитань, зв’яжіться з нами будь-яким з цих способів.

  • Вакансія Field Application Scientist in Next Generation Sequencing

    Вакансія Field Application Scientist in Next Generation Sequencing

    Наші друзі з BioLabTech шукають спеціаліста на позицію Field Application Scientist in Next Generation Sequencing.

    Навіть якщо ви не підходите на 100% під вимоги, проте вважаєте себе гарним кандидатом, зв’яжіться з компанією, бо є можливості інтенсивної освітньої програми.

    Для зв’язку та надсилання резюме: hr@biolabtech.com.ua

    Вимоги до кандидата:

    PhD в біології, спеціалізація в генетичних дослідженнях. Досвід наукової та практичної роботи в лабораторії від 5 років. Глибокий рівень знань методів молекулярної біології, генетики. Гарні комунікативні якості. Здатність швидко навчатися та набувати нових практичних навичок. Здатність проведення ефективних презентацій перед аудиторією. Вміння навчати як теоретично, так і на практиці. Знання англійської мови не нижче B2.

    Обовязки:

    • Консультування клієнтів з питань, що стосуються технології і продуктів для NGS
    • Інсталяція приладів для NGS та проведення навчання користувачів систем для секвенування повному робочому процесу від пробопідготовки до аналізу результатів
    • Консультативна підтримка користувачів систем для секвенування
    • Допомога користувачам у вирішенні проблемних ситуацій
    • Проведення семінарів, демонстраційних сесій, участь у конференціях

    Компанія «Біолабтех» забезпечує умови для росту кваліфікації персоналу завдяки участі у тренінгах, школах.

  • Трансляційні дослідження

    Трансляційні дослідження

    Запрошуємо вас відвідати відкриту лекцію “Трансляційні дослідження: scientia vincere morbum” від організації Genomics UA.
    Від першої стрічки коду, від першого натискання піпеткою до нового лікування певної хвороби — саме в цьому полягає сила трансляційних досліджень. На лекції ми обговоримо:
    І) що таке трансляційні дослідження;
    ІІ) приклади, коли вони призвели до позитивних наслідків для пацієнтів та для суспільства;
    ІІІ) хто працює над ними та чим ці люди займаються;
    ІV) які кар’єрні можливості існують в цьому напрямі.

    Для кого: в лекції буде використовуватися наукова термінологія, яка знайома студентам та спеціалістам біомедичних напрямів, проте лекція орієнтована на широку аудиторію і буде зрозуміла всім, хто цікавиться чи працює у life sciences.
    Лектор: Oleksandr Petrenko, лікар, PhD-студент в Ludwig Boltzmann Institute for Rare and Undiagnosed Diseases та Predoctoral Fellow у CeMM (Research Center for Molecular Medicine of the Austrian Academy of Sciences), співзасновник громадської організації “Геноміка ЮА”, автор блогу mutation.me – biomedicine 4U.

    Коли: 14 лютого, 17:00 – 19:00.
    Де: Одеська обласна універсальна наукова бібліотека ім. М.Грушевського, другий поверх. https://goo.gl/maps/oRJXC6KSpuauGnG28.
    Вхід: безкоштовний.

    Оригінал зображення: “Metastatic Melanoma Cells”, Julio C. Valencia, NCI Center for Cancer Research, ліцензія CC BY-NC 2.0

  • Зустріч з нанопорного секвенування

    Зустріч з нанопорного секвенування

    Запрошуємо Вас на зустріч Київського біоінформатичного клубу.
    Де: пр. Перемоги, 37, бібліотека КПІ, зала 1.2
    Коли: 8 лютого, о 12:00.

    План заходу:
    1. Оглядова лекція про технологію нанопорного секвенування, прилади сімейства Oxford Nanopore, плюси та мінуси секвенування третього покоління.
    Лектор: Dmytro Kazanzhy, дата-аналітик.

    2. Кейс аналізу даних нанопорного секвенування з використанням хмарних сервісів (Google Cloud Platform).
    Проект стосувався визначення мікроорганізмів та їх асоціації, що викликають сепсис у реанімаційних хворих.
    Лектор: Severyn Parkhomenko, інженер-програміст, data scientist в The APP Solutions.

    3. Нетворкінг
    Ми б дуже хотіли, щоб кожен з вас поділився своїми вміннями та інтересами. Це допоможе знайти однодумців для майбутніх проектів. Кожному надається 3-5 хвилин для розповіді + 2 хвилини на запитання аудиторії. Можна з презентацією.
    Лектор – кожен з Вас.

  • Вакансія Principal Investigator

    Вакансія Principal Investigator

    Вакансія від Research Center for Molecular Medicine of the Austrian Academy of Sciences (CeMM).

    Якщо ви дослідник зі ступенем MD та/або PhD, зверніть увагу: CeMM шукає мотивованих кандидатів на позицію Starting Principal Investigator.
    Деталі за посиланням:

    Лінк

  • Повногеномний пошук асоціацій (GWAS) поведінкових ознак

    Повногеномний пошук асоціацій (GWAS) поведінкових ознак

    UPD: Щойно ми відкрили доступ до запису зустрічі.

    У разі запитань чи уточнень щодо доповіді, ви можете звернутися безпосередньо до лекторів (Олександр Шинкаренко та Валерія Телиженко), або написати коментар у соціальних мережах.

    Приєднуйтесь до нас, щоб взяти участь у наступній зустрічі журнального клубу чи запропонувати наукову публікацію для огляду.
    https://www.facebook.com/GenomicsUA/
    https://www.t.me/GenomicsUA/

    Анонс події

    На черговій зустрічі біомедичного журнального клубу обговоримо Полногеномний пошук асоціацій (GWAS) поведінкових ознак на прикладі статті “Large-scale GWAS reveals insights into the genetic architecture of same-sex sexual behavior“.
    Доповідачі: Alexander Shynkarenko та Valeria Telizhenko.

    Посилання на трансляцію буде опубліковано в телеграм-каналі GenomicsUA

    Матеріали для підготовки:

    Посилання на подію в ФБ.