Tag: Спільнота

  • Лекція: Statistical mechanics models for cell differentiation

    Лекція: Statistical mechanics models for cell differentiation

    ✌️Усім привіт!

    🙃Ми дуже давно з вами не бачилися й, чесно кажучи, дуже за вами скучили!
    Однак, є чудовий привід виправити це, а заодно й поговорити про статистичне моделювання клітинної диференціації.
    🧑‍💻На лекції ми розглянемо теоретичні основи різних методи сатистичного моделювання та покажемо приклад на мовах програмування R і Python.

    🇬🇧Мова події: англійська
    🧑‍🏫Лектори: Валерія Васильєва та Ігор Ареф’єв
    📅Коли: 20.11.2021 19:00 (Київ)
    📍Де: Zoom (https://us02web.zoom.us/j/82407615516?pwd=U1BUSzNpT2RldC91dm1GNmw3c0trdz09)
    📌Подія у Facebook: https://fb.me/e/1EMzbgQHQ

  • Геноміка ЮА на Школі успіху

    Геноміка ЮА на Школі успіху

    Друзі, а знаєте, що ми робимо? Ми з радістю анонсуємо, що команда Геноміки приєдналася до ініціативи “Школа успіху. Костянтинівка”!🥳

    🧬 Цей проєкт пропонує діалог між учнями шкіл і фахівцями з біології та пов’язаних з нею напрямів. У “Школі” ви зустрінете трьох учасників нашої команди:
    📍 Валерія розповість про досвід навчання на біологічній спеціальності в Україні;
    📍 Владислав поділиться досвідом застосування біоінформатики в наукових біомедичних проєктах;
    📍 Юлія поділиться досвідом кар’єри в біології та біоінформатиці у США та Європі.

    📣 Ми будемо дуже вдячні, якщо ви допоможете популяризувати цей захід. Для цього запросіть на заходи “Школи” знайомих учнів, які планують будувати кар’єру в біомедичних напрямках. А якщо ви самі маєте якісь питання на цьому етапі, то надішліть їх нам і ми спробуємо їх обговорити.

    🔎 Деталі онлайн-заходу та реєстрація за посиланням:
    https://www.facebook.com/events/1032688914205020.

  • Візуалізація даних

    Візуалізація даних

    Всім привіт✌️
    У нас тут знову намічається зустріч!

    💻 Запрошуємо усіх на вебінар, де ми обговоримо теорію статичної візуалізації даних та розглянемо практичні приклади на мовах програмування R та Python.

    📝 План заходу:
    1. Теорія та практика;
    2. Бібліотеки Python: matplotlib та seaborn;
    3. Бібліотека R: ggplot2.

    🧑‍🏫 Лектори:
    Марина Коршевнюк — PhD candidate, University Medical Center Groningen.
    Дмитро Казанжи — Data analyst, National Health Service of Ukraine.
    Олександр Петренко — PhD Student, Ludwig Boltzmann Institute for Rare and Undiagnosed Diseases.

    📅 Коли: 22 липня 2021, 19:00 (Київ)

    🌎Де: Zoom
    (https://us02web.zoom.us/j/82769997848?pwd=ZkdhUEtBQzB3M3puVlhHcHBBTFdGQT09)

    🗓Додати до календаряhttps://calendar.google.com/event?action=TEMPLATE&tmeid=MGo3ZWFndXNodWw5YjRpbGtxMjVkZ3Njam0gZ2Vub21pY3N1YS5vcmdAbQ&tmsrc=genomicsua.org%40gmail.com

  • Дорожня карта у біоінформатиці

    Дорожня карта у біоінформатиці

    З чого почати вивчення біоінформатики?

    Аби допомогти початківцям та студентам розпочати вивчення біоінформатики, ми узагальнили наш досвід та рекомендації у Roadmap до біоінформатики. Тут ви можете вибрати будь-який шлях та розпочати вивчати основні теми, необхідні для успіху в аналізі біологічних даних.

    Якщо ви хочете адаптувати для себе цей постер, сміливо копіюйте та редагуйте його версію draw.io.

    А якщо ви досвідчений біоінформатик, ми будемо надзвичайно раді вашому внеску у вдосконалення та завершення цієї візуалізації!

  • Лекція “Адаптивний ландшафт”

    Лекція “Адаптивний ландшафт”

    Даний захід відбудеться завдяки організаційній підтримці Олени Мельник, учасниці спільноти “Геноміка ЮА”.
    Лекція буде присвячена еволюційній біології, а саме взаємодії навколишнього середовища та організму.
    ❓Як живі організми стали такими, якими ми їх знаємо сьогодні?
    ❓Як функції та фенотипи змінюються з часом?
    ❓Як зміни генотипу впливають на пристосованість?
    ❓Як у всьому Цьому допомагає обчислювальна біологія?
    Усі ці питання будуть розглянуті під час лекції.
    👨‍🏫 Лектор: професор Федір Кондрашов, IST Austria.
    📅 Дата: 28.01.2021, початок о 18:00 (київський час).
    🌎 Де: Zoom, дані для підключення (https://us02web.zoom.us/j/88498182724?pwd=bTFnaWJNejZkemNLbnR0aXQrYkpwQT09):
    Лекція буде проводитися російською мовою і, за необхідності, організатори допоможуть з перекладом під час сесії «питання-відповідь».

  • Training course in single-cell biology

    Training course in single-cell biology

    Single-cell analysis is an extremely powerful tool to discover biological processes due to its high resolution and wide range of possibilities. So we decided to organize a short but in-depth course in this field. We would like to invite you to our practical course in single-cell biology to become familiar with core single-cell analysis methods.
    This course is a series of online events that highlight the theoretical basics of single-cell analysis. The program covers sample preparation, data processing, and workshops on different pipelines, including scRNAseq, scATACseq, TCR/BCR sequencing, CITEseq, and much more.

    Meeting days are:

    • Sunday, 4.04.2021
    • Monday, 5.04.2021
    • Wednesday, 7.04.2021
    • Friday, 9.04.2021
    • Saturday, 10.04.2021

    Each meeting starts at 18.00 CET and will take approximately 2-3 hours. The format of the event is Zoom-meeting with breakout-rooms if needed. All participants will be supplied with individual tasks, study materials, and instructions for hands-on sessions.

    Speakers:

    • Vladyslav Kavaka, MD candidate, LMU Munich
    • Maryna Korshevniuk, PhD Candidate, UMCG
    • Oleksandr Petrenko, Predoctoral Fellow, LBI-RUD / CeMM
    • Yuliya Syntikova, PhD, LifeMine Therapeutics

    Requirements:

    • Basic knowledge in cell and molecular biology;
    • Basic skills in R programming language;
    • No prior knowledge of single-cell analysis is required.

    Language: English

    Registration:
    To register for the course in single-cell biology, please complete the following form: https://forms.gle/H3zXb1ofaSvZ3bKg8
    The deadline for registration is 31.03.2021.
    Detailed programs will be announced one week before the event. All participants will receive the mail with further instructions and study materials.

  • Нетворкінг з NextStep Science

    Нетворкінг з NextStep Science

    Запрошуємо всіх бажаючих до нетворкінгу з учасниками NextStep Science (http://nextstepscience.org/) — громадської організації, що організовує нетворкінг-івенти та кар’єрні заходи для студентів і випускників природничих наук.

    Ми почнемо з невеличкого “квізу” на платформі Sli.do, щоб зрозуміти чим хто займається та які теми цікавлять аудиторію події.
    Потім в ми розділимось на кімнати по 2-3 людини, де у кожного буде 5 хвилин на те щоб поспілкуватись і познайомитися один з одним. Ця процедура буде повторена тричі.
    Після цього ми розділимось на ~2 окремі кімнати, де будемо обговорювати наперед підготовлену організаторами тему.
    А наприкінці події кожен зможе поспілкуватись один з одним в окремих кімнатах.


    👨‍🔬👩‍🔬Це чудова нагода познайомитись із новими людьми, які так само захоплені наукою та технологіями.
    🇬🇧🖖Офіційні мови спілкування: англійська та клінгонська.
    🌎Де: Zoom
    (https://zoom.us/j/94145503186)📅Коли: 7 лютого 2021 о 19:00 (UTC+02)
    Щоб отримати турботливе нагадування, ось подія в ФБ (https://fb.me/e/USSZA6fv).

  • Лекція “Мутації у Homo Sapiens”

    Лекція “Мутації у Homo Sapiens”

    Даний захід відбудеться завдяки організаційній підтримці Олени Мельник, учасниці спільноти “Геноміка ЮА”.

    Кожен новонароджений має близько ста нових мутацій, з яких приблизно десять — шкідливі.
    ❓Наскільки пристосованість людини через це знижена?
    ❓Чи слід чекати накопичення шкідливих алелів у популяціях, що живуть у шкідливих умовах?
    ❓Чи буде користь від редагування генотипів?
    Усі ці питання будуть розглянуті під час лекції.

    👨‍🏫 Лектор: професор Олексій Кондрашов, Університет Мічигану, США.
    📅 Дата: 11.01.2021, початок о 18:00 (київський час).
    🌎 Де: Zoom, дані для підключення доступні після реєстрації: https://us02web.zoom.us/meeting/register/tZ0kcOmvrz0jG9cww20ZCFtkkCALpKwfTWtT
    Лекція читатиметься російською мовою, та за необхідності організатори допоможуть з перекладом під час сесії «питання-відповідь».

    Зображення заходу використовує знімок Кліффа з Арлінгтона, штат Вірджинія, США, опублікований під ліцензією Creative Commons Attribution 2.0 Generic (https://www.flickr.com/people/28567825@N03).

  • Біоінформатика: з чого почати

    Біоінформатика: з чого почати

    Мабуть, кожному відомо, що в 21 сторіччі важливі відкриття відбуваються у дисциплінах, які є на межі двох, або більше наук. Прикладом такої є біоінформатика, де біологічні дані обробляються комп’ютерними алгоритмами і дають відповіді на загадки природи. У новачків, що зацікавились біоінформатикою, виникає питання: “А що треба знати, щоб стати біоінформатиком?”
    Саме тому ми вирішили зібрати курси та ресурси, які допоможуть вам на цьому шляху. Напевно, треба починати з розуміння роботи в операційних системах сімейства Linux та програмування на мові R, але не забувайте читати цікаві статті та пробувати використовувати на практиці отримані знання.

    Якщо ви рекомендуєте якийсь курс, напишіть t.me/kazanzhy або залиште коментар в Google-документі. Команда “Геноміка ЮА” буде дуже вдячна за допомогу. Щоб переглянути у більш зручному вигляді перейдіть за посиланням на Google-документ.

    https://docs.google.com/document/d/1XuSB8qApfOfb3625Lhg4C3TzCpsAWtoSwngypjIlYXU/edit?usp=sharing

  • Pandas та ML workshop

    Pandas та ML workshop

    У вересні відбулись два семінара по введенню в машинне навчання від Jenya Sidyakin та про основи бібліотеки Pandas від Dmytro Kazanzhy.