Tag: Освіта

  • Lecture: From patients to genetics – paralyzing struggles of translating ALS by Sophie Imhof

    Lecture: From patients to genetics – paralyzing struggles of translating ALS by Sophie Imhof

    The topic of the lecture: From patients to genetics – paralyzing struggles of translating ALS
    Speaker: Sophie Imhof, PhD Student at the Medical University of Vienna, Department of Neurology, author of a blog for science communication: https://www.instagram.com/sophie_imhof/
    When: 05.06.2020 at 18:00 (Vienna time) | 19:00 (Kyiv time).
    Where: Online. We invite you to connect via Zoom to participate in the discussion after the lecture, or to join the YouTube translation. The access links will be provided after free registration: https://www.eventbrite.com/e/105936210056

    Open lectures of the NGO “Genomics UA” ​​is a non-formal education format in which invited experts talk about their projects or research field. After a presentation, we organize a Q&A session with the speaker and provide an opportunity for informal communication and networking.

    Amyotrophic lateral sclerosis is a fast progressing and lethal neurodegenerative disease that predominantly affects the upper and lower motor neurons. To this point, there is no cure for this pathology and patients have a life expectancy of 3 months to 5 years. Only 10% of cases are due to genetic and hereditary reasons (familial ALS), leaving 90% of patients in the dark of the underlying mechanism of their pathology (sporadic ALS). Only two FDA approved compounds, Riluzole, which prolongs life for up to 3 months, and Edaravone, which was shown to slow down disease progression, are used to treat ALS patients, however, they remain drugs of low efficiency. Out of this reason, researchers worldwide are establishing models and using state-of-the-art technology to investigate this disease. Although our community of ALS scientists and clinicians is eager to beat this pathology, we face many obstacles in the form of patient heterogeneity, different molecular phenotypes, and technical limitations. To overcome these burdens, I believe we need to change our mindset and perspective on this disease and step one step back to discover novel niches of research. Patient cohorts, genetics, iPSCs, stem cell therapy, vitamin supplements – what do we actually know about this disease and how can we pave a new path for effective treatment?

    Additional information:
    – How can I join and ask questions?
    – You need to register on zoom.com (it’s free), download the program, go to the link provided in the event announcement, and enter the password. Or just enter the meeting ID and password if you have already installed and opened the program. If possible, join our meetings with a turned-on camera, it helps to create a presence effect for more informal communication. Participants usually turn off the microphone while someone else is talking. If you have questions before the end, feel free to send them to the chat. If you can not join us via Zoom, there is an alternative to join through the YouTube stream. If you watch us on YouTube, you can ask questions in the chat and our moderators will check them.

    – I liked the event / I have more questions / I want to be in touch with you.
    – First of all, thank you for your interest! We have put together a biomedical community in Telegram and you are invited to join. Go to the channel https://t.me/GenomicsUA, subscribe, and in the description, you will find a link to the chat. If you are not a Telegram user, feel free to drop your question to i@genomics.org.ua, or to our Facebook page.

    Don’t forget to subscribe to our Facebook page:
    https://www.facebook.com/GenomicsUA
    To our YouTube channel:
    https://www.youtube.com/ngogenomicsua
    And to the local representative office of the organization:
    Kyiv: https://www.facebook.com/kyivbioinformatics/
    Odesa: https://www.facebook.com/odesabioinformatics/
    If you have any questions, please contact us in any of these ways.

    Приємного перегляду!

  • ATAC-me і перепрограмування клітин

    ATAC-me і перепрограмування клітин

    Biomedical Journal Club – це проєкт громадської організації “Геноміка ЮА”. Під час журнального клубу один учасник доповідає про обрану наукову статтю, а слухачі можуть ставити запитання. Після презентації відбувається неформальне спілкування та нетворкінг.

    + На цій зустрічі ми обговоримо статтю:
    Barnett K.R. et al. ATAC-Me Captures Prolonged DNA Methylation of Dynamic Chromatin Accessibility Loci during Cell Fate Transitions
    https://www.cell.com/molec…/fulltext/S1097-2765(20)30004-6
    + Доповідач: Іван Берест, PhD студент в European Molecular Biology Laboratory, біоінформатик (https://twitter.com/jambocurious).
    + Коли: 22 квітня 2020 о 19:00 (київський час).
    + Де: онлайн. Ми робимо дзвінок-конференцію в Zoom, до якого може приєднатися кожен. Там доповідач транслює презентацію, можна ставити питання та брати участь у дискусії. Якщо в вас немає змоги приєднатися через Zoom, ми робимо трансляцію (крім неформальної частини та нетворкінгу) на нашому YouTube-каналі.
    Zoom: https://us02web.zoom.us/j/84990970614… | Meeting ID: 849 9097 0614 | Password: genomicsua
    YouTube: https://youtu.be/Jc0g3EuXSBU

    FAQ:
    — Що таке журнальний клуб?
    — Це формат, який працює в багатьох інститутах та лабораторіях по всьому світу: доповідач презентує статтю та додаткову інформацію, необхідну для її розуміння, аналізує експериментальну частину, переваги та недоліки. Після цього учасники зустрічі оговорюють статтю. Взагалі, це гарний спосіб навчитися новому, дізнатися про інші напрями, познайомитися з новими людьми.

    — Як мені підготуватися для зустрічі?
    — Дуже рекомендується прочитати саму статтю та подивитися ілюстрації. Це допоможе визначити запитання та теми для дискусії. Якщо тема для вас є новою чи складною, рекомендовано ознайомитися з базовими поняттями. Якщо вам потрібна рекомендація, що прочитати на певну тему, запитайте нас!

    — Як мені приєднатися та ставити запитання?
    — Вам потрібно зареєструватися на zoom.com (це безкоштовно), звантажити програму, перейти по посиланню, яке надане в анонсі події та ввести приведений пароль. Чи просто ввести meeting ID та пароль, якщо ви вже встановили та відкрили програму. Якщо є змога, приєднуйтесь з веб-камерою, це допомагає створити ефект присутності задля більш неформального спілкування. Зазвичай учасники виключають мікрофон (“mute”), доки спілкується хтось інший. Якщо в вас виникли запитання до завершення доповіді, ви можете надіслати їх в чат, чи запитати через мікрофон. Якщо ви дивитесь нас через YouTube, ви можете залишати запитання в чаті трансляції.

    — Мені сподобалось / є запитання / хочу бути на зв’язку з вами.
    — Перш за все, дякуємо за вашу зацікавленість! Ми зібрали біомедичну спільноту в Telegram і ви можете приєднатися. Перейдіть на канал https://t.me/GenomicsUA, підпишіться і в описі ви знайдете посилання на чат.
    Не забудьте підписатися на нашу сторінку Facebook:
    https://www.facebook.com/GenomicsUA
    На наш YouTube-канал:
    https://www.youtube.com/ngogenomicsua
    Та на локальне представництво організації:
    Київ: https://www.facebook.com/kyivbioinformatics/
    Одеса: https://www.facebook.com/odesabioinformatics/
    В разі запитань, зв’яжіться з нами будь-яким з цих способів.

  • Introduction to single-cell sequencing

    Introduction to single-cell sequencing

    We want to invite you to visit open lectures “Introduction to single-cell sequencing” of the Kyiv Bioinformatics Club.
    During the two meetings, we will talk about how the single-cell technologies were invented, how they were evolved and how to determine the DNA / RNA sequences of each individual cell.

    Lecturer: Maryna Korshevniuk, a student at the Max Delbrück Center for Molecular Medicine in the Helmholtz Association.
    Her interests: single-cell technologies, multi-omics.

    When: February 10th and 11th, 2020 from 7:00 PM
    Where: Bohomolets Institute of Physiology, Main Building, Second Floor, room 212.
    Address: 4, Bogomolets Street, Kyiv

    IMPORTANT UPDATE: All lectures will be conducted in English.

  • Трансляційні дослідження

    Трансляційні дослідження

    Запрошуємо вас відвідати відкриту лекцію “Трансляційні дослідження: scientia vincere morbum” від організації Genomics UA.
    Від першої стрічки коду, від першого натискання піпеткою до нового лікування певної хвороби — саме в цьому полягає сила трансляційних досліджень. На лекції ми обговоримо:
    І) що таке трансляційні дослідження;
    ІІ) приклади, коли вони призвели до позитивних наслідків для пацієнтів та для суспільства;
    ІІІ) хто працює над ними та чим ці люди займаються;
    ІV) які кар’єрні можливості існують в цьому напрямі.

    Для кого: в лекції буде використовуватися наукова термінологія, яка знайома студентам та спеціалістам біомедичних напрямів, проте лекція орієнтована на широку аудиторію і буде зрозуміла всім, хто цікавиться чи працює у life sciences.
    Лектор: Oleksandr Petrenko, лікар, PhD-студент в Ludwig Boltzmann Institute for Rare and Undiagnosed Diseases та Predoctoral Fellow у CeMM (Research Center for Molecular Medicine of the Austrian Academy of Sciences), співзасновник громадської організації “Геноміка ЮА”, автор блогу mutation.me – biomedicine 4U.

    Коли: 14 лютого, 17:00 – 19:00.
    Де: Одеська обласна універсальна наукова бібліотека ім. М.Грушевського, другий поверх. https://goo.gl/maps/oRJXC6KSpuauGnG28.
    Вхід: безкоштовний.

    Оригінал зображення: “Metastatic Melanoma Cells”, Julio C. Valencia, NCI Center for Cancer Research, ліцензія CC BY-NC 2.0

  • Зустріч з нанопорного секвенування

    Зустріч з нанопорного секвенування

    Запрошуємо Вас на зустріч Київського біоінформатичного клубу.
    Де: пр. Перемоги, 37, бібліотека КПІ, зала 1.2
    Коли: 8 лютого, о 12:00.

    План заходу:
    1. Оглядова лекція про технологію нанопорного секвенування, прилади сімейства Oxford Nanopore, плюси та мінуси секвенування третього покоління.
    Лектор: Dmytro Kazanzhy, дата-аналітик.

    2. Кейс аналізу даних нанопорного секвенування з використанням хмарних сервісів (Google Cloud Platform).
    Проект стосувався визначення мікроорганізмів та їх асоціації, що викликають сепсис у реанімаційних хворих.
    Лектор: Severyn Parkhomenko, інженер-програміст, data scientist в The APP Solutions.

    3. Нетворкінг
    Ми б дуже хотіли, щоб кожен з вас поділився своїми вміннями та інтересами. Це допоможе знайти однодумців для майбутніх проектів. Кожному надається 3-5 хвилин для розповіді + 2 хвилини на запитання аудиторії. Можна з презентацією.
    Лектор – кожен з Вас.

  • Ландшафт поодиноких клітин при патології раку молочної залози

    Ландшафт поодиноких клітин при патології раку молочної залози

    На зустрічі біомедичного журнального клубу ми обговоримо статтю:
    𝗧𝗵𝗲 𝘀𝗶𝗻𝗴𝗹𝗲-𝗰𝗲𝗹𝗹 𝗽𝗮𝘁𝗵𝗼𝗹𝗼𝗴𝘆 𝗹𝗮𝗻𝗱𝘀𝗰𝗮𝗽𝗲 𝗼𝗳 𝗯𝗿𝗲𝗮𝘀𝘁 𝗰𝗮𝗻𝗰𝗲𝗿
    (https://www.nature.com/articles/s41586-019-1876-x)

    Презентацію по статті підготовить Maryna Korshevniuk – студентка в Max Delbrück Center for Molecular Medicine in the Helmholtz Association. В сферу інтересів лекторки входить 𝘚𝘪𝘯𝘨𝘭𝘦-𝘤𝘦𝘭𝘭 𝘵𝘦𝘤𝘩𝘯𝘰𝘭𝘰𝘨𝘪𝘦𝘴 та мультиоміка.

    Коли: 2 лютого 2020 о 20:00
    Де: online, https://www.youtube.com/watch?v=9_qzQ7uuTQ0

  • Повногеномний пошук асоціацій (GWAS) поведінкових ознак

    Повногеномний пошук асоціацій (GWAS) поведінкових ознак

    UPD: Щойно ми відкрили доступ до запису зустрічі.

    У разі запитань чи уточнень щодо доповіді, ви можете звернутися безпосередньо до лекторів (Олександр Шинкаренко та Валерія Телиженко), або написати коментар у соціальних мережах.

    Приєднуйтесь до нас, щоб взяти участь у наступній зустрічі журнального клубу чи запропонувати наукову публікацію для огляду.
    https://www.facebook.com/GenomicsUA/
    https://www.t.me/GenomicsUA/

    Анонс події

    На черговій зустрічі біомедичного журнального клубу обговоримо Полногеномний пошук асоціацій (GWAS) поведінкових ознак на прикладі статті “Large-scale GWAS reveals insights into the genetic architecture of same-sex sexual behavior“.
    Доповідачі: Alexander Shynkarenko та Valeria Telizhenko.

    Посилання на трансляцію буде опубліковано в телеграм-каналі GenomicsUA

    Матеріали для підготовки:

    Посилання на подію в ФБ.

  • Comparative cross-species transcriptomics for lifespan

    Comparative cross-species transcriptomics for lifespan

    Відео лекції Comparative cross-species transcriptomics for lifespan, яку нещодавно прочитав Ursu Eugen з Institute of Biochemistry of the Romanian Academy.

    Приємного перегляду!

  • Сучасна біотехнологія і фарміндустрія

    Сучасна біотехнологія і фарміндустрія

    Запис вебінару з кар’єрних можливостей у сфері біотехнологій та фармацевтичній індустрії.

    Лектор: Юлія Ситнікова

    Приємного перегляду!

  • Четвертий семінар RoBioinfo

    Четвертий семінар RoBioinfo

    Команда Одеського біоінформатичного клубу прийняла участь у четвертому семінарі румунського біоінформатичного товариства в Бухаресті і ми вважаємо важливим висловити подяку тим, хто допоміг зробити це можливим.

    Ми дуже вдячні людям з компанії BioLabTech, Ltd за те, що повірили в нас і надали тревел грант для відвідування семінару. Ми будемо намагатися зробити так, щоб набуті тут контакти і знання позитивно вплинули на українську галузь геноміки та біоінформатики.

    Ми вдячні організаторам заходу, Societatea Română de Bioinformatică та особисто Robi Tacutu, його команді і партнерам семінару за можливість бути присутніми, за дуже потужну освітню програму і за надання покриття реєстраційного внеску.

    Ми поділимося враженнями і будемо планувати подальшу активність клубу дуже скоро. Слідкуйте за нашими новинами!