Реєстрацію на курс завершено і щойно усім, хто заповнив анкету реєстрації, був надісланий лист щодо статусу зарахування на курс й доступу до просторів курсу.
Якщо ви реєструвалися, але не отримали листа – щось пішло не так. Напишіть на team-genomics@genomics.org.ua.
Усі подальші оголошення під час курсу будуть відбуватися в Google Workspace. Побачимося 13-го січня!
Давайте поговоримо про deep tech стартапи і те, як їх будувати.
Більшість стартапів адаптують існуючі технології для вирішення існуючих проблем. Але є проблеми, які неможливо вирішити існуючими технологіями. Відповідно деякі компанії сфокусовані навколо розробки нових технологій задля розв’язання проблем, які поки ніхто не може вирішити. Це довгий та високоризиковий процес, що визначає всі інші аспекти побудови та розвитку таких компаній від підбору персоналу до пошуку інвестицій.
🤝Я Алекс, співзасновник і колишній технічний директор deep tech стартапу HTuO Biosciences і я хочу розповісти про певні принципи й прийоми, які на мою думку, корисні при побудові deep tech стартапів.
🎄Буду радий бачити вас на нашій зустрічі наступного року, а поки що бажаю вам веселих свят!
Коли: 15 січня 2025, 19:00 за Києвом
Де: https://meet.google.com/fkb-hssi-csx
Вітаємо спільноту Геноміки ЮА!
На початку 2025 року наша команда проведе новий освітній курс. Цей курс є частиною великої програми LifeSciencesCourse, яку профінансували DAAD, і яку координують наші колеги з кафедри біохімії та біотехнології ПНУ та Universität Tübingen.
Цей практичний онлайн-курс є продовженням напрямку, який ми викладали у 24-му році на цій ініціативі (транскриптоміка). На цей раз ми сфокусуємося на більш просунутих методах й аналізі їх даних, а саме: транскриптоміка поодиноких клітин (single-cell RNA-sequencing), просторова біологія (spatial biology / transcriptomics) та мультиоміка. На курсі будуть два модулі: перший для тих, хто хотів би опанувати R для аналізу біологічних (і не тільки) даних; другий по біоінформатичному аналізу даних. Оскільки курс буде практичним, від учасників очікується проходження матеріалу паралельно з інструкторами. Інструктори представлені як командою Геноміки ЮА, так і запрошеними фахівцями з академії та індустрії України, ЄС та США.
Курс орієнтований на студентів та аспірантів, хоча участь з інших кар’єрних рівнів не обмежується. Попереднього знання або навичок в R або в темах, які описані вище, не потребується; успішне завершення курсу можливо завдяки опрацюванню матеріалів та порад, отриманих під час курсу. За успішне проходження* курсу учасники можуть отримати наступні сертифікати:
* успішне проходження передбачає активну участь на курсі та успішне і вчасне проходження тестування. Просто присутність без активності не є критерієм проходження курсу. Критерії для сертифіката LifeSciencesCourse ви можете подивитися на їх сайті під час реєстрації на курс.
Завдяки фінансуванню DAAD, 18 студентів або аспірантів, які постраждали в наслідок війни й успішно пройдуть курс, можуть отримати стипендії по €400. Деталі про стипендії також можна почитати при реєстрації.
Ми запрошуємо усіх охочих реєструватися на курс й бажаємо успішного кар’єрного розвитку у 2025-му році.
Сторінка курсу на сайті LifeSciencesCourse (реєстрація, програма): http://lifesciencescourse.org/vstup-do-r-ta-rnk-sekvenuvannya. Також закликаємо передивитися їх інші курси 2025-го року.
Реєстрація: на сайті LifeSciencesCourse до 2025-01-10.
Реєстрацію на курс розпочато! (2024-12)
Новини щодо курсу на нашому сайті: тут.
Хочемо запросити вас на семінар від наших друзів з Bioinformatics for Ukraine. Наступного четверга вони проводять зустріч, присвячену експресії генів. На ній буде про те, що таке транскриптоміка, в яких дослідженнях її застосовують, та чому вміння аналізувати транскриптомні дані відкриває багато кар’єрних можливостей
Розповідати про це буде Олександр Петренко, науковий співробітник Медичного університету Відня, співзасновник Геноміки ЮА та один з інструкторів курсу з аналізу даних РНК-секвенування.
Коли: 21-го березня, 7 вечора за Києвом.
Реєстрація: Google Spreadsheet. Зв’язок з організаторами: лінк.
🧬 Запрошуємо на наступну зустріч Журнального клубу Геноміки ЮА!
Ми обговоримо нещодавно анонсований інструмент від Google DeepMind AlphaMissense [https://doi.org/10.1126/science.adg7492].
✍️ Стаття розкриває новітній підхід до передбачення патогенності міссенс-мутацій у всьому протеомі людини. Цей інноваційний підхід базується на прогресі у галузі машинного навчання, навчання на мовних моделях білків та використанні структурного контексту з моделей AlphaFold. Результати AlphaMissense вже показали високу точність у клінічних анотаціях, варіантах захворювань та експериментальних випробуваннях.
— Марина Коршевнюк, організаторка зустрічі
⌛️ Коли: 24 листопада 2023, 19:00 (Київ) / 18:00 (CET) / 12PM (EST)
📍 Де: https://us02web.zoom.us/j/81857634532?pwd=Tm5zT0dBREpWRnI2NEdOTjM1aGwydz09
🔬 Тема обговорення:
Запрошуємо всіх зацікавлених учасників продивитися статтю, приєднатися до нашого обговорення та ділитися своїми ідеями та думками!
Починається останній тиждень нашого курсу, де учасники будуть презентувати результати аналізу даних секвенування РНК. Як того набору даних, який ми аналізували разом (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE205555), так і тих, що відібрали учасники самостійно. Ми переконані, що ці навички допоможуть у пошуку роботи й для наукових проєктів. Разом з тим, ми відкрили доступ до платформи тестування, і перший учасник вже отримав сертифікат. Вітаємо Святослава!
За останній місяць ми переробили сайт і перенесли його на окремий сервер, а разом з тим впровадили GenomicsID. Це – єдиний логін на наші чинні та майбутні сервіси, які ми будемо додавати та розробляти. Наразі це ними є пошта на @genomics.org.ua та платформа для тестування. Якщо раптом комусь з учасників спільноти потрібна така адреса пошти для професійних цілей, можемо надати доступ в обмін на пожертву фонду “Повернись живим”. За бажанням, відправляйте скриншот свіжого донату разом зі своїм ім’ям на hello@genomics.org.ua
R – база! 📊
Багато зареєстрованих на курс з аналізу секвенування РНК ніколи не працювали із R. Тож ми приготували практичну зустріч, щоб вам допомогти.
На воркшопі ви побачите та спробуєте наступне:
➕ Навігація в Rstudio.
➕ Корисні стартові команди.
➕ Синтаксис R, типи та структури даних.
➕ Зберігання та завантаження файлів.
➕ Прості маніпуляції із даними.
➕ Петлі та галуження коду, написання функцій.
➕ Створення графічного відображення даних.
➕ Робота із пакетом tidyverse.
Коли: 23 вересня 2023, о 19:00 (Київ) / 18:00 (CET)
Де: Zoom
(https://us02web.zoom.us/j/84767265916?pwd=dWoxbG0vdTU2V0ovUmMxcjJNKy9iUT09)Для участі необхідно попередньо встановити R та Rstudio. Ми рекомендуємо це зробити за зразком цього відео (https://www.youtube.com/watch?v=TFGYlKvQEQ4). Якщо ви маєте операційну систему відмінну від Windows, встановлюйте файли із назвою вашої операційної системи.
Ми вже додали відео вчорашньої практичної зустрічі. Подивитися її можна ось тут: https://youtu.be/ET01eAXm1tE
🧬📘 Запрошуємо вас відвідати наступну зустріч Геноміки!
Сергій Науменко, вчений-біоінформатик, презентує свій посібник з біоінформатики українською мовою. Сергій обговорить його ключові елементи та проведе обмін думками з учасниками. Запрошена спікерка, редакторка Ольга Васильєва, просвітить учасників стосовно процесу підготовки посібника та поділиться досвідом перекладу з наукової на літературну мову.
Посібник у відкритому доступі: GitHub (https://github.com/naumenko-sa/bioinf_posibnyk_public/blob/main/bioinf_posibnyk.pdf)
На тих, хто відвідає зустріч, чекає унікальна можливість поглибити професійні знання у сфері біоінформатики, відкрити нові перспективи для кар’єрного росту та стати частиною наукової дискусії. А бонусом, наприкінці заходу ми зробимо великий анонс стосовно нашого наступного проєкту. Чекаємо на вас!
Коли: 15 липня 2023, 18:00 (Київ) / 11:00 (EST)
Де: Zoom (https://us02web.zoom.us/j/81031555698?pwd=VmZXMXRQWkpNRER4NURpWFFrL3k2Zz09)