GENOMICS UA | Геноміка ЮА

Tag: Новини

  • East European Bioinformatics and Computational Genomics Workshop 2025

    Ви теж пам’ятаєте це фото? А давай повторимо цьогоріч у Польщі🌟

    Наші друзі Bioinformatics for Ukraine організують East European Bioinformatics and Computational Genomics Workshop

    EEBG 2025 підготує учасників до вдосконалення своїх навичок у галузі геномних досліджень, персоналізованої медицини та обчислювальної біології в науковому співтоваристві.

    А точніше:
    ✔️Практичні заняття з використанням наборів геномних даних
    ✔️Навчання пошуку геномних варіантів, визначенню походження за ДНК, та біомедичним методологіям на основі ШІ
    ✔️Можливості для встановлення міжнародних зв’язків і спільних досліджень

    Коли: 7 -12 липня 2025
    Де: Kraków
    Реєстрація: до 12-го травня за посиланням (https://eebg2025.edu.pl/register/)
    💶Є можливість податися на стипендію, що покриває витрати на реєстрацію та проживання.

    -Класно! Але я не можу приїхати :(
    -Тоді подавайся на віртуальну участь ;)

    Якщо таки їдете, зробіть фото! Вам не складно – нам приємно 🤗

  • Systems Biology Group at IMBG, Kyiv is looking for a Master student

    Учасниця спільноти Геноміка ЮА шукає помічника/помічницю у найбіоінформатичному українському науковому проєкті. Оце так шанс розширити свій біоінформатичний toolkit😲

    📢 We’re Hiring! MSc in Bioinformatics

    Systems Biology Group at IMBG, Kyiv is looking for a Master student 🧠, who would work on creating robust and automated pangenome-driven pipeline for prokaryotic genomes annotation 🧬. The pipeline aims to be fast and scalable, thus being able to process thousands of assembled genomes for a reasonable amount of time. The pangenome-centric annotation would require research on efficient data structures and graph architecture (e.g. gene-centric vs de Bruijn graph of k-mers). The project is supposed to be conducted as part of Master thesis 🔬 (Bachelor is still possible, but you should allocate enough time and meet the requirements).

    Requirements:
    🐍 Solid knowledge of Python
    👨‍💻 Linux, Git, upper-intermediate English, troubleshooting/debugging skills.

    Optional:
    ✅ NextFlow, Bakta, understanding of genomic data formats.

    📅 Deadline: 21 Apr 2025

    🚀For more details, please write to admin@sysbio.org.ua

  • Запрошуємо на літню школу Computational Research Advances in Biomedical Sciences (CRABS)

    Запрошуємо на літню школу Computational Research Advances in Biomedical Sciences (CRABS)

    Геноміка ЮА запрошує на літню школу Computational Research Advances in Biomedical Sciences (CRABS)!

    Цю школу організують наші друзі з Київської школи економіки та ГО “ГМО”. Учасники школи візьмуть участь в біоінформатичних воркшопах та відвідають лекції від представників факультету, куди запрошені дослідники з різних університетів ЄС та США. Після загальної програми, учасники зможуть обрати спеціалізований трек й розвивати свої навички в одному з напрямів: (1) Omics data analysis; (2) Structural bioinformatics & drug development; (3) Bioinformatics for disease research and diagnostics. Слідкуйте за новинами на сайті, оскільки далі будуть анонсовані нові треки. Окрім навичок, учасники, які успішно виконають програму школи, отримають сертифікат з 3 ECTS від КШЕ.

    Сподіваємося побачити багато учасників спільноти Геноміки ЮА на заході!

    Коли: 10-17 серпня 2025
    Де: Київ, оффлайн
    Деталі та реєстрація: https://crabs.kse.ua до 2025-04-15

    – – –

    Дисклеймер: ми публікуємо цю можливість на безоплатній основі як інформаційні партнери заходу.

  • Science2Business запрошують науковців та науковиць

    Science2Business запрошують науковців та науковиць

    До нас звернулися INNOV8, щоб розповісти про їх проєкт аудиторії Геноміки ЮА. Вони та їх партнери запрошують українських вчених (та тих, хто працює з наукомісткими проєктами) стати учасниками Science2Business. Ця програма належить до ініціативи ЄС Seeds of Bravery й націлена на допомогу з реалізацією інноваційних ідей як бізнесів. Серед напрямків програми, особливо релевантних для нашої спільноти, є біотехнології, охорона здоров’я, хімія, технології подвійного призначення.

    Учасники програми візьмуть участь в тренінгових заходах, а також отримають тематичне менторство. Організатори підкреслюють, що випускники програми зможуть податися на фінансування Seeds of Bravery.

    Зареєструватися на програму можна до 14 лютого 2025 року, 18:00.

    Деталі, реєстрація, та оголошення тут: https://innovate.com.ua/science2business/

  • Реєстрацію на курс “ВСТУП В R ТА РНК-СЕКВЕНУВАННЯ: БІОЛОГІЯ ПООДИНОКИХ КЛІТИН ТА ПРОСТОРОВА БІОЛОГІЯ” завершено. Ми щойно вислали підтвердження зарахованим учасникам

    Реєстрацію на курс “ВСТУП В R ТА РНК-СЕКВЕНУВАННЯ: БІОЛОГІЯ ПООДИНОКИХ КЛІТИН ТА ПРОСТОРОВА БІОЛОГІЯ” завершено. Ми щойно вислали підтвердження зарахованим учасникам

    Реєстрацію на курс завершено і щойно усім, хто заповнив анкету реєстрації, був надісланий лист щодо статусу зарахування на курс й доступу до просторів курсу.

    Якщо ви реєструвалися, але не отримали листа – щось пішло не так. Напишіть на team-genomics@genomics.org.ua.

    Усі подальші оголошення під час курсу будуть відбуватися в Google Workspace. Побачимося 13-го січня!

  • Анонс курсу “ВСТУП В R ТА РНК-СЕКВЕНУВАННЯ: БІОЛОГІЯ ПООДИНОКИХ КЛІТИН ТА ПРОСТОРОВА БІОЛОГІЯ”

    Анонс курсу “ВСТУП В R ТА РНК-СЕКВЕНУВАННЯ: БІОЛОГІЯ ПООДИНОКИХ КЛІТИН ТА ПРОСТОРОВА БІОЛОГІЯ”

    Вітаємо спільноту Геноміки ЮА!

    На початку 2025 року наша команда проведе новий освітній курс. Цей курс є частиною великої програми LifeSciencesCourse, яку профінансували DAAD, і яку координують наші колеги з кафедри біохімії та біотехнології ПНУ та Universität Tübingen.

    Цей практичний онлайн-курс є продовженням напрямку, який ми викладали у 24-му році на цій ініціативі (транскриптоміка). На цей раз ми сфокусуємося на більш просунутих методах й аналізі їх даних, а саме: транскриптоміка поодиноких клітин (single-cell RNA-sequencing), просторова біологія (spatial biology / transcriptomics) та мультиоміка. На курсі будуть два модулі: перший для тих, хто хотів би опанувати R для аналізу біологічних (і не тільки) даних; другий по біоінформатичному аналізу даних. Оскільки курс буде практичним, від учасників очікується проходження матеріалу паралельно з інструкторами. Інструктори представлені як командою Геноміки ЮА, так і запрошеними фахівцями з академії та індустрії України, ЄС та США.

    Курс орієнтований на студентів та аспірантів, хоча участь з інших кар’єрних рівнів не обмежується. Попереднього знання або навичок в R або в темах, які описані вище, не потребується; успішне завершення курсу можливо завдяки опрацюванню матеріалів та порад, отриманих під час курсу. За успішне проходження* курсу учасники можуть отримати наступні сертифікати:

    • Від LifeScienceCourse на 2 ECTS;
    • Від Геноміки ЮА за проходження тестування модуля 2 на 70%+;
    • Від Геноміки ЮА за виконання опціонального групового курсового проєкту.

    * успішне проходження передбачає активну участь на курсі та успішне і вчасне проходження тестування. Просто присутність без активності не є критерієм проходження курсу. Критерії для сертифіката LifeSciencesCourse ви можете подивитися на їх сайті під час реєстрації на курс.

    Завдяки фінансуванню DAAD, 18 студентів або аспірантів, які постраждали в наслідок війни й успішно пройдуть курс, можуть отримати стипендії по €400. Деталі про стипендії також можна почитати при реєстрації.

    Ми запрошуємо усіх охочих реєструватися на курс й бажаємо успішного кар’єрного розвитку у 2025-му році.

    Сторінка курсу на сайті LifeSciencesCourse (реєстрація, програма): http://lifesciencescourse.org/vstup-do-r-ta-rnk-sekvenuvannya. Також закликаємо передивитися їх інші курси 2025-го року.
    Реєстрація: на сайті LifeSciencesCourse до 2025-01-10.

  • Щодо перенесення спільноти з Telegram до Google Workspace

    Щодо перенесення спільноти з Telegram до Google Workspace

    🚨BREAKING🚨

    “РНБО прийняла рішення щодо заборони встановлення та використання Telegram на службових пристроях працівників органів державної влади, працівників сектору безпеки і оборони, учасників громадської організації «Геноміка ЮА»….”
    Ну що ж робити, РНБО заборонила, тож виконуємо…

    Ми починаємо поступову транзицію спільноти Геноміка ЮА з Телеграму до Google Workspace.

    Чому?

    ☕️З початку повномасштабного вторгнення Геноміка ЮА планувала переїхати на іншу платформу. Ми взяли участь у програмі Google for NGO та отримали безлімітний доступ до Google Workspace для нашої спільноти. Тепер усе готово й ми хочемо запросити тебе до нас на біоінформатичну каву.

    🗨Genomics UA Workspace дає такі бонуси: схожі на Slack та зручні в користуванні чати, які дозволяють підключати застосунки; 20Gb диску (з можливістю значного розширення на запит для наукових проєктів) і пошта Gmail на домені genomics.org.ua для особистого або професійного користування.

    🕺💃Genomics UA Workspace буде ідеальною платформою для колаборації між біоінформатиками України, адже там легко запланувати онлайн-зустріч або створити подію з учасниками спільноти в календарі.

    🔥Genomics UA Workspace показав свій потужний потенціал під час нещодавнього курсу “РНК секвенування: аналіз даних в R”. (http://lifesciencescourse.org/rnk-sekvenuvannya-analiz-danykh-v-r) Ми вже запровадили one-click access з єдиним акаунтом на вебсайт та систему Moodle, а в подальшому він буде використовуватися і для доступу до наших обчислювальних ресурсів. Надалі всі події будемо хостити там.

    🔫Телеграм є зручною, але сумнівною соцмережею. Останнім часом до нашого чату доєднується багато анонімів, а це точно не сприяє тісній взаємодії. Рішення РНБО (а також те, що грантовим агенціям потрібно знати, скільки ми маємо реальних студентів/учених у спільноті) для нас є знаком діяти😼.

    Так що, ти з нами?

    Аби отримати свій акаунт на Genomics UA Workspace, заповни форму. Вона має на меті деанонімізувати спільноту, тому в ній ми просимо тебе трохи про себе розповісти (звісно, в межах ЗУ “Про захист персональних даних” та GDPR😉)

    Наші канал і чат залишатимуться активними. А втім, рекомендуємо доєднатися до нас на Workspace зараз, аби не губити важливу інформацію.
    P.S. До того ж, усі наші освітні проєкти тепер будуть саме там.

  • Учасники Геноміки ЮА на BioGENext

    Учасники Геноміки ЮА на BioGENext

    Частина учасників спільноти Геноміки ЮА на конференції BioGENext (https://t.me/GenomicsUA/214) в Києві.

    Приходьте послухати доповіді учасників й подивитися постери цими днями 🙂

    Фото: Soniia Hatych (http://t.me/tewtydry)

  • Учасники Геноміки ЮА на EEBG-24

    Учасники Геноміки ЮА на EEBG-24

    Фото: частина учасників спільноти Геноміки ЮА та BioInUA (http://t.me/bioinua), які взяли участь в Eastern European Bioinformatics and Computational Genomics School.

    7-20 липня в Ужгороді відбувається Biological Data Science Summer School, тож запрошуємо ділитися враженнями і фотографіями з обох заходів в чаті (http://t.me/bioinformaticsua).

  • Публікація в Cell Systems: The resilience of Ukrainian scientists

    Публікація в Cell Systems: The resilience of Ukrainian scientists

    ▶️ Сьогодні вийшла публікація “The resilience of Ukrainian scientists (https://www.cell.com/cell-systems/fulltext/S2405-4712(24)00091-7)” в Cell Systems, серед співавторів якої є багато учасників нашої спільноти.

    ▶️ Це – важлива композиція коментарів про те, як війна впливає на українську науку і науковців. Вона містить ті думки та послання, які особливо важливо побачити нашим закордонним колегам та друзям: від Валерія, який поставив кар’єру на паузу та мобілізувався одразу після вторгнення; від дослідників в українських інститутах, які продовжують працювати попри все; та від українських дослідників в закордонних інститутах.

    ▶️ Дуже важливо поділитися публікацією з вашими закордонними колегами, особливо якщо ви користуєтеся LinkedIn та Twitter або аналогічними платформами – тож будемо вам вдячні за це. Доступ: https://www.cell.com/cell-systems/fulltext/S2405-4712(24)00091-7#%20