GENOMICS UA | Геноміка ЮА

Category: Проєкти

  • Бактеріальні нуклеотиди та метод рідинної хроматографії

    Бактеріальні нуклеотиди та метод рідинної хроматографії

    Відкриті лекції від ГО “Геноміка ЮА” — це формат, в якому запрошені фахівці розповідають про свій проєкт, чи про науковий напрям, а слухачі можуть ставити запитання. Після презентації відбувається неформальне спілкування та нетворкінг.

    + Темою цієї лекції стане вивчення бактеріальних нуклеотидів за допомогою методу високоефективної рідинної хроматографії (ВРХ). На зустрічі лекторка представить статтю про застосування методу ВРХ в сучасних наукових дослідженнях та розповість про базові принципи роботи з хроматографом.
    Посилання на статтю:
    https://www.nature.com/articles/s41598-017-10988-6
    + Доповідачка: Tatyana Brodiazhenko, PhD-студентка в University of Tartu (Estonia) і assistant researcher в Umeå University (Sweden).
    + Коли: 30.04.2020 о 19:00 (за київським часом).
    + Де: онлайн. Ми робимо дзвінок-конференцію в Zoom, до якого може приєднатися кожен. Там доповідач транслює презентацію, можна ставити питання та брати участь у дискусії. Якщо в вас немає змоги приєднатися через Zoom, ми робимо трансляцію (крім неформальної частини та нетворкінгу) на нашому YouTube-каналі.
    Zoom: Meeting ID: 828 8853 5621, Password: genomicsua
    https://us02web.zoom.us/j/82888535621?pwd=S1BSMmxLK1F0UHFzRGEzMUhBajFnUT09
    YouTube: https://youtu.be/A3N1lkSQV4I

    FAQ:
    — Як мені приєднатися та ставити запитання?
    — Вам потрібно зареєструватися на zoom.com (це безкоштовно), звантажити програму, перейти по посиланню, яке надане в анонсі події та ввести приведений пароль. Чи просто ввести meeting ID та пароль, якщо ви вже встановили та відкрили програму. Якщо є змога, приєднуйтесь з веб-камерою, це допомагає створити ефект присутності задля більш неформального спілкування. Зазвичай учасники виключають мікрофон (“mute”), доки спілкується хтось інший. Якщо в вас виникли запитання до завершення доповіді, ви можете надіслати їх в чат, чи запитати через мікрофон. Якщо ви дивитесь нас через YouTube, ви можете залишати запитання в чаті трансляції.— Мені сподобалось / є запитання / хочу бути на зв’язку з вами.
    — Перш за все, дякуємо за вашу зацікавленість! Ми зібрали біомедичну спільноту в Telegram і ви можете приєднатися. Перейдіть на канал https://t.me/GenomicsUA, підпишіться і в описі ви знайдете посилання на чат.
    Не забудьте підписатися на наші сторінки Facebook:
    https://www.facebook.com/GenomicsUA
    https://www.facebook.com/BioinformaticsUA
    На наш YouTube-канал:
    https://www.youtube.com/ngogenomicsua
    В разі запитань, зв’яжіться з нами будь-яким з цих способів.

    подивитися запис

  • Регуляція структури хроматину транспозонами

    Запрошуємо вас на онлайн-зустріч біомедичного журнального клубу, де разом з Valeria Vasylyeva розберемось, як транспозони підтримують структуру хроматину.
    Рекомендуємо ознайомитися зі статтею для плідної дискусії.
    Стаття: https://genomebiology.biomedcentral.com/…/s13059-019…
    Де: online.
    Є можливість приєднатися до онлайн-конференції в Zoom, щоб мати змогу поспілкуватися зі спікеркою та брати участь у дискусії, чи дивитися трансляцію на Youtube.
    Коли: 11 квітня 2020, 19:00 – 21:00 за київським часом.

    Як приєднатися до зустрічі журнального клубу:

    1. Якщо ви бажаєте взяти участь у дискусії, ставити запитання, поспілкуватися зі спікеркою, то підключайтеся через Zoom (zoom.com, реєстрація та використання безкоштовні). Запитання можна буде писати в чаті, чи задати особисто після докладу.
    Лінк заходу: https://us02web.zoom.us/j/112073341…
    Meeting ID: 112 073 341
    Password: genomicsua

    2. Якщо ви не можете приєднатися через Zoom, є можливість дивитися трансляцію на Youtube. Можна писати запитання в чаті трансляції, проте пріоритет буде за запитаннями з Zoom.
    https://youtu.be/wsdIg0wnVq8

    Якщо вам потрібна допомога з налаштуванням, дайте знати нам через приватні повідомлення сторінки https://www.facebook.com/GenomicsUA, ибо через телеграм-чат каналу t.me/GenomicsUA.

    подивитися захід

  • Introduction to single-cell sequencing

    Introduction to single-cell sequencing

    We want to invite you to visit open lectures “Introduction to single-cell sequencing” of the Kyiv Bioinformatics Club.
    During the two meetings, we will talk about how the single-cell technologies were invented, how they were evolved and how to determine the DNA / RNA sequences of each individual cell.

    Lecturer: Maryna Korshevniuk, a student at the Max Delbrück Center for Molecular Medicine in the Helmholtz Association.
    Her interests: single-cell technologies, multi-omics.

    When: February 10th and 11th, 2020 from 7:00 PM
    Where: Bohomolets Institute of Physiology, Main Building, Second Floor, room 212.
    Address: 4, Bogomolets Street, Kyiv

    IMPORTANT UPDATE: All lectures will be conducted in English.

    подивитися запис
  • Зустріч з нанопорного секвенування

    Зустріч з нанопорного секвенування

    Запрошуємо Вас на зустріч Київського біоінформатичного клубу.
    Де: пр. Перемоги, 37, бібліотека КПІ, зала 1.2
    Коли: 8 лютого, о 12:00.

    План заходу:
    1. Оглядова лекція про технологію нанопорного секвенування, прилади сімейства Oxford Nanopore, плюси та мінуси секвенування третього покоління.
    Лектор: Dmytro Kazanzhy, дата-аналітик.

    2. Кейс аналізу даних нанопорного секвенування з використанням хмарних сервісів (Google Cloud Platform).
    Проект стосувався визначення мікроорганізмів та їх асоціації, що викликають сепсис у реанімаційних хворих.
    Лектор: Severyn Parkhomenko, інженер-програміст, data scientist в The APP Solutions.

    3. Нетворкінг
    Ми б дуже хотіли, щоб кожен з вас поділився своїми вміннями та інтересами. Це допоможе знайти однодумців для майбутніх проектів. Кожному надається 3-5 хвилин для розповіді + 2 хвилини на запитання аудиторії. Можна з презентацією.
    Лектор – кожен з Вас.

  • Ландшафт поодиноких клітин при патології раку молочної залози

    Ландшафт поодиноких клітин при патології раку молочної залози

    На зустрічі біомедичного журнального клубу ми обговоримо статтю:
    𝗧𝗵𝗲 𝘀𝗶𝗻𝗴𝗹𝗲-𝗰𝗲𝗹𝗹 𝗽𝗮𝘁𝗵𝗼𝗹𝗼𝗴𝘆 𝗹𝗮𝗻𝗱𝘀𝗰𝗮𝗽𝗲 𝗼𝗳 𝗯𝗿𝗲𝗮𝘀𝘁 𝗰𝗮𝗻𝗰𝗲𝗿
    (https://www.nature.com/articles/s41586-019-1876-x)

    Презентацію по статті підготовить Maryna Korshevniuk – студентка в Max Delbrück Center for Molecular Medicine in the Helmholtz Association. В сферу інтересів лекторки входить 𝘚𝘪𝘯𝘨𝘭𝘦-𝘤𝘦𝘭𝘭 𝘵𝘦𝘤𝘩𝘯𝘰𝘭𝘰𝘨𝘪𝘦𝘴 та мультиоміка.

    Коли: 2 лютого 2020 о 20:00
    Де: online, https://www.youtube.com/watch?v=9_qzQ7uuTQ0

    подивитися запис
  • Повногеномний пошук асоціацій (GWAS) поведінкових ознак

    Повногеномний пошук асоціацій (GWAS) поведінкових ознак

    UPD: Щойно ми відкрили доступ до запису зустрічі.

    У разі запитань чи уточнень щодо доповіді, ви можете звернутися безпосередньо до лекторів (Олександр Шинкаренко та Валерія Телиженко), або написати коментар у соціальних мережах.

    Приєднуйтесь до нас, щоб взяти участь у наступній зустрічі журнального клубу чи запропонувати наукову публікацію для огляду.
    https://www.facebook.com/GenomicsUA/
    https://www.t.me/GenomicsUA/

    Анонс події

    На черговій зустрічі біомедичного журнального клубу обговоримо Полногеномний пошук асоціацій (GWAS) поведінкових ознак на прикладі статті “Large-scale GWAS reveals insights into the genetic architecture of same-sex sexual behavior“.
    Доповідачі: Alexander Shynkarenko та Valeria Telizhenko.

    Посилання на трансляцію буде опубліковано в телеграм-каналі GenomicsUA

    Матеріали для підготовки:

    Посилання на подію в ФБ.

  • Kyiv Bioinformatics Club Meeting

    Kyiv Bioinformatics Club Meeting

    Біоінформатичний клуб — це спільнота для навчання біоінформатиці, створення проектів та спілкування. Ми запрошуємо приєднатися до зустрічі для створення спільноти в Києві всіх, кому цікава біоінформатика, хто працює в цьому напрямку або бажає дізнатися більше.

    Під час першої зустрічі на вас чекають три лекції та нетворкінг. Деталі щодо програми можна дізнатися за посиланням:
    http://bit.ly/2WJh1k5

    Коли: 18 травня, 14:00 — 18:00
    Де: 12 зала Бібліотека КПІ / KPI Library на проспекті Перемоги 37, станція метро “Політехнічний інститут” (http://bit.ly/2WN1Jet)
    Вхід: безкоштовний за умови реєстрації (https://forms.gle/a4czwWfq4x6NPAen8)

  • Команда Геноміки ЮА на RoBioInfo Seminar

    Команда Геноміки ЮА на RoBioInfo Seminar

    Цими днями команда #odesabioinformaticsclub працює на заході 4th @RoBioinfo Seminar: NGS Data Analysis в Бухаресті і ми вважаємо важливим висловити подяку тим, хто допоміг зробити це можливим.

    Ми дуже вдячні людям з компанії BioLabTech, Ltd за те, що повірили в нас і надали тревел грант для відвідування семінару. Ми будемо намагатися зробити так, щоб набуті тут контакти і знання позитивно вплинули на українську галузь геноміки та біоінформатики.

    Ми вдячні організаторам заходу, Societatea Română de Bioinformatică та особисто Robi Tacutu, його команді і партнерам семінару за можливість бути присутніми, за дуже потужну освітню програму і за надання покриття реєстраційного внеску.

    Ми поділимося враженнями і будемо планувати подальшу активність клубу дуже скоро. Слідкуйте за нашими новинами!

  • Четвертий семінар RoBioinfo

    Четвертий семінар RoBioinfo

    Команда Одеського біоінформатичного клубу прийняла участь у четвертому семінарі румунського біоінформатичного товариства в Бухаресті і ми вважаємо важливим висловити подяку тим, хто допоміг зробити це можливим.

    Ми дуже вдячні людям з компанії BioLabTech, Ltd за те, що повірили в нас і надали тревел грант для відвідування семінару. Ми будемо намагатися зробити так, щоб набуті тут контакти і знання позитивно вплинули на українську галузь геноміки та біоінформатики.

    Ми вдячні організаторам заходу, Societatea Română de Bioinformatică та особисто Robi Tacutu, його команді і партнерам семінару за можливість бути присутніми, за дуже потужну освітню програму і за надання покриття реєстраційного внеску.

    Ми поділимося враженнями і будемо планувати подальшу активність клубу дуже скоро. Слідкуйте за нашими новинами!

  • Перша біоінформатична зустріч в Одесі

    Перша біоінформатична зустріч в Одесі

    21-го грудня ми зустрілися в Одеська обласна універсальна наукова бібліотека ім. М.Грушевського, щоб поспілкуватися і заглянути у світ біоінформатики. Сподіваюся, що наші зустрічі будуть регулярними і стануть основою нашої спільноти.

    Приєднуйтесь, якщо вам цікава біоінформатика!