GENOMICS UA | Геноміка ЮА

Category: Освітні заходи

  • Захист курсових проєктів з біології поодиноких клітин та просторової біології!

    Захист курсових проєктів з біології поодиноких клітин та просторової біології!

    Запрошуємо на відкритий захист командних курсових проєктів курсу Геноміки ЮА з біології поодиноких клітин та просторової біології!

    Під час зустрічі учасники курсу презентують мету аналізу наборів даних, хід аналізу, знахідки та їх інтерпретації. Наприкінці кожної презентації інструктори та відвідувачі зможуть ставити учасникам запитання.

    Теми курсових проєктів, представлених на захист, наступні:
    К1 (“Арррр”) – Spatially resolved cell types and signatures in INPP5D-deficient Alzheimer’s mice
    К2 – Просторова транскриптоміка в контексті біомедичних досліджень: методи stemness, Xenium, Merfish та Visium
    К3 – Функціональна гетерогенність фібробластів у шкірі людини: одноклітинний транскриптомний аналіз та вікові зміни
    К4 – Differential gene expression in single cells between preclinical and clinical stages of Alzheimer’s disease.
    К5 – Аналіз даних секвенування РНК поодиноких клітин гліобластоми людини
    К6 – Single-Cell Transcriptomic Analysis of Hematopoietic Stem and Progenitor Cells in Acute Myeloid Leukemia and Chemotherapy Respons
    К7 – Дослідження змін, спричинених опроміненням
    К8 – Просторовий аналіз клітин у багатоканальних зображеннях: сегментація та оцінка експресії маркерів
    К9 – Вплив перебування в космосі на клітини мозку: аналіз за допомогою просторової транскриптоміки

    Розклад: в зображенні новини.
    Коли: 2025-04-23 та 2025-04-27, початок о 19:00 (київський час)
    Посилання: 2025-04-23 (https://youtube.com/live/tgIMlGe7_3k) та 2025-04-27 (https://youtube.com/live/J1BRSe4vrN0)

  • East European Bioinformatics and Computational Genomics Workshop 2025

    Ви теж пам’ятаєте це фото? А давай повторимо цьогоріч у Польщі🌟

    Наші друзі Bioinformatics for Ukraine організують East European Bioinformatics and Computational Genomics Workshop

    EEBG 2025 підготує учасників до вдосконалення своїх навичок у галузі геномних досліджень, персоналізованої медицини та обчислювальної біології в науковому співтоваристві.

    А точніше:
    ✔️Практичні заняття з використанням наборів геномних даних
    ✔️Навчання пошуку геномних варіантів, визначенню походження за ДНК, та біомедичним методологіям на основі ШІ
    ✔️Можливості для встановлення міжнародних зв’язків і спільних досліджень

    Коли: 7 -12 липня 2025
    Де: Kraków
    Реєстрація: до 12-го травня за посиланням (https://eebg2025.edu.pl/register/)
    💶Є можливість податися на стипендію, що покриває витрати на реєстрацію та проживання.

    -Класно! Але я не можу приїхати :(
    -Тоді подавайся на віртуальну участь ;)

    Якщо таки їдете, зробіть фото! Вам не складно – нам приємно 🤗

  • Запрошуємо на літню школу Computational Research Advances in Biomedical Sciences (CRABS)

    Запрошуємо на літню школу Computational Research Advances in Biomedical Sciences (CRABS)

    Геноміка ЮА запрошує на літню школу Computational Research Advances in Biomedical Sciences (CRABS)!

    Цю школу організують наші друзі з Київської школи економіки та ГО “ГМО”. Учасники школи візьмуть участь в біоінформатичних воркшопах та відвідають лекції від представників факультету, куди запрошені дослідники з різних університетів ЄС та США. Після загальної програми, учасники зможуть обрати спеціалізований трек й розвивати свої навички в одному з напрямів: (1) Omics data analysis; (2) Structural bioinformatics & drug development; (3) Bioinformatics for disease research and diagnostics. Слідкуйте за новинами на сайті, оскільки далі будуть анонсовані нові треки. Окрім навичок, учасники, які успішно виконають програму школи, отримають сертифікат з 3 ECTS від КШЕ.

    Сподіваємося побачити багато учасників спільноти Геноміки ЮА на заході!

    Коли: 10-17 серпня 2025
    Де: Київ, оффлайн
    Деталі та реєстрація: https://crabs.kse.ua до 2025-04-15

    – – –

    Дисклеймер: ми публікуємо цю можливість на безоплатній основі як інформаційні партнери заходу.

  • Реєстрацію на курс “ВСТУП В R ТА РНК-СЕКВЕНУВАННЯ: БІОЛОГІЯ ПООДИНОКИХ КЛІТИН ТА ПРОСТОРОВА БІОЛОГІЯ” завершено. Ми щойно вислали підтвердження зарахованим учасникам

    Реєстрацію на курс “ВСТУП В R ТА РНК-СЕКВЕНУВАННЯ: БІОЛОГІЯ ПООДИНОКИХ КЛІТИН ТА ПРОСТОРОВА БІОЛОГІЯ” завершено. Ми щойно вислали підтвердження зарахованим учасникам

    Реєстрацію на курс завершено і щойно усім, хто заповнив анкету реєстрації, був надісланий лист щодо статусу зарахування на курс й доступу до просторів курсу.

    Якщо ви реєструвалися, але не отримали листа – щось пішло не так. Напишіть на team-genomics@genomics.org.ua.

    Усі подальші оголошення під час курсу будуть відбуватися в Google Workspace. Побачимося 13-го січня!

  • Анонс курсу “ВСТУП В R ТА РНК-СЕКВЕНУВАННЯ: БІОЛОГІЯ ПООДИНОКИХ КЛІТИН ТА ПРОСТОРОВА БІОЛОГІЯ”

    Анонс курсу “ВСТУП В R ТА РНК-СЕКВЕНУВАННЯ: БІОЛОГІЯ ПООДИНОКИХ КЛІТИН ТА ПРОСТОРОВА БІОЛОГІЯ”

    Вітаємо спільноту Геноміки ЮА!

    На початку 2025 року наша команда проведе новий освітній курс. Цей курс є частиною великої програми LifeSciencesCourse, яку профінансували DAAD, і яку координують наші колеги з кафедри біохімії та біотехнології ПНУ та Universität Tübingen.

    Цей практичний онлайн-курс є продовженням напрямку, який ми викладали у 24-му році на цій ініціативі (транскриптоміка). На цей раз ми сфокусуємося на більш просунутих методах й аналізі їх даних, а саме: транскриптоміка поодиноких клітин (single-cell RNA-sequencing), просторова біологія (spatial biology / transcriptomics) та мультиоміка. На курсі будуть два модулі: перший для тих, хто хотів би опанувати R для аналізу біологічних (і не тільки) даних; другий по біоінформатичному аналізу даних. Оскільки курс буде практичним, від учасників очікується проходження матеріалу паралельно з інструкторами. Інструктори представлені як командою Геноміки ЮА, так і запрошеними фахівцями з академії та індустрії України, ЄС та США.

    Курс орієнтований на студентів та аспірантів, хоча участь з інших кар’єрних рівнів не обмежується. Попереднього знання або навичок в R або в темах, які описані вище, не потребується; успішне завершення курсу можливо завдяки опрацюванню матеріалів та порад, отриманих під час курсу. За успішне проходження* курсу учасники можуть отримати наступні сертифікати:

    • Від LifeScienceCourse на 2 ECTS;
    • Від Геноміки ЮА за проходження тестування модуля 2 на 70%+;
    • Від Геноміки ЮА за виконання опціонального групового курсового проєкту.

    * успішне проходження передбачає активну участь на курсі та успішне і вчасне проходження тестування. Просто присутність без активності не є критерієм проходження курсу. Критерії для сертифіката LifeSciencesCourse ви можете подивитися на їх сайті під час реєстрації на курс.

    Завдяки фінансуванню DAAD, 18 студентів або аспірантів, які постраждали в наслідок війни й успішно пройдуть курс, можуть отримати стипендії по €400. Деталі про стипендії також можна почитати при реєстрації.

    Ми запрошуємо усіх охочих реєструватися на курс й бажаємо успішного кар’єрного розвитку у 2025-му році.

    Сторінка курсу на сайті LifeSciencesCourse (реєстрація, програма): http://lifesciencescourse.org/vstup-do-r-ta-rnk-sekvenuvannya. Також закликаємо передивитися їх інші курси 2025-го року.
    Реєстрація: на сайті LifeSciencesCourse до 2025-01-10.

  • lifesciencecource

    СПІВПРАЦЯ З lifesciencecourse.org

    Вступ в R та РНК-секвенування: біологія поодиноких клітин та просторова біологія (2025)

    Реєстрацію на курс розпочато! (2024-12)

    Новини щодо курсу на нашому сайті: тут.

    РНК-секвенування: аналіз даних в R (2024)

    • Це перша подія, проведена в Google Workspace.
    • Захист групових робіт був відкритий для всієї спільноти через YouTube трансляцію.

  • Educational projects

    ОСВІТНІ ЗАХОДИ

    Викладаємо у співпраці з lifesciencecourse

    Студенти-початківці в біоінформатиці мають нагоду здобути навички в програмуванні та аналізі біологічних даних, отримати навчальний кредит та фінансову підтримку з огляду на скрутне становище через війну.

    читати далі

    Практичний курс з біології поодиноких клітин (2021)

    Короткий курс є серією онлайн-подій, які висвітлюють теоретичні основи аналізу поодиноких клітин. Програма охоплює підготовку зразків, обробку даних і семінари з різних пайплайнів, включаючи scRNAseq, scATACseq, секвенування TCR/BCR, CITEseq та багато іншого.

    читати далі

    Наставляємо молодих науковців

    Експрес-курс, де розглядаються ключові аспекти вступу на навчальні програми та пошук роботи в біомедичній сфері.

    читати далі

    Практичні зустрічі

    Буває, очі розбігаються від кількості туторіалів в інтернеті! А буває, навчального матеріалу не вистачає… Члени Геноміка ЮА підтримують зростаюче покоління біоінформатиків і радо діляться навичками із колегами.

    читати далі

    Лекції від фахівців

    Біоінформатика блискавично поповнюється новими методами й напрямками досліджень. Наша спільнота слідкує за актуальними темами через спілкування із запрошеними фахівцями з передових областей.

    читати далі

    Збагачуємо український біоінформатичний словник

    Чітке визначення ключових понять є основою взаєморозуміння й ефективної співпраці. Кожен може долучитися до впровадження найвлучніших українських відповідників до біоінформатичних термінів.

    читати далі

    Путівник

    Тут ми збираємо корисну інформацію для тих, хто хоче розвивати кар’єру у біоінформатиці.

    читати далі

  • Introduction to single-cell sequencing

    Introduction to single-cell sequencing

    We want to invite you to visit open lectures “Introduction to single-cell sequencing” of the Kyiv Bioinformatics Club.
    During the two meetings, we will talk about how the single-cell technologies were invented, how they were evolved and how to determine the DNA / RNA sequences of each individual cell.

    Lecturer: Maryna Korshevniuk, a student at the Max Delbrück Center for Molecular Medicine in the Helmholtz Association.
    Her interests: single-cell technologies, multi-omics.

    When: February 10th and 11th, 2020 from 7:00 PM
    Where: Bohomolets Institute of Physiology, Main Building, Second Floor, room 212.
    Address: 4, Bogomolets Street, Kyiv

    IMPORTANT UPDATE: All lectures will be conducted in English.

    подивитися запис