🧳 Як і для багатьох науковців, літо для Геноміки ЮА — це час конференцій
Активна учасниця нашої спільноти Аліна Фролова представила надбання та перепони на шляху формування української біоінформатичної спільноти на ISMB/ECCB 2025 у Ліверпулі.
4 стовпи української біоінформатики
🏛️ NGO Genomics UA 🏛️ Bioinformatics for Ukraine 🏛️ UBDS^3: Ukrainian Biological Data Science Summer School 🏛️ NGO Geneticly Modified Organisation
об’єдналися, щоб на міжнародному рівні поділитися унікальним досвідом розвитку біоінформатичної освіти, дізнатися про нові можливості для членів спільнот і подякувати за неймовірну підтримку українських науковців. 🔥Потужна колаба — потужний виступ — 1000% профіту для спільноти!
Запрошуємо на відкритий захист командних курсових проєктів курсу Геноміки ЮА з біології поодиноких клітин та просторової біології!
Під час зустрічі учасники курсу презентують мету аналізу наборів даних, хід аналізу, знахідки та їх інтерпретації. Наприкінці кожної презентації інструктори та відвідувачі зможуть ставити учасникам запитання.
Теми курсових проєктів, представлених на захист, наступні: К1 (“Арррр”) – Spatially resolved cell types and signatures in INPP5D-deficient Alzheimer’s mice К2 – Просторова транскриптоміка в контексті біомедичних досліджень: методи stemness, Xenium, Merfish та Visium К3 – Функціональна гетерогенність фібробластів у шкірі людини: одноклітинний транскриптомний аналіз та вікові зміни К4 – Differential gene expression in single cells between preclinical and clinical stages of Alzheimer’s disease. К5 – Аналіз даних секвенування РНК поодиноких клітин гліобластоми людини К6 – Single-Cell Transcriptomic Analysis of Hematopoietic Stem and Progenitor Cells in Acute Myeloid Leukemia and Chemotherapy Response К7 – Дослідження змін, спричинених опроміненням К8 – Просторовий аналіз клітин у багатоканальних зображеннях: сегментація та оцінка експресії маркерів К9 – Вплив перебування в космосі на клітини мозку: аналіз за допомогою просторової транскриптоміки
Ви теж пам’ятаєте це фото? А давай повторимо цьогоріч у Польщі🌟
Наші друзі Bioinformatics for Ukraine організують East European Bioinformatics and Computational Genomics Workshop
EEBG 2025 підготує учасників до вдосконалення своїх навичок у галузі геномних досліджень, персоналізованої медицини та обчислювальної біології в науковому співтоваристві.
А точніше: ✔️Практичні заняття з використанням наборів геномних даних ✔️Навчання пошуку геномних варіантів, визначенню походження за ДНК, та біомедичним методологіям на основі ШІ ✔️Можливості для встановлення міжнародних зв’язків і спільних досліджень
Коли: 7 -12 липня 2025 Де: Kraków Реєстрація: до 12-го травня за посиланням (https://eebg2025.edu.pl/register/) 💶Є можливість податися на стипендію, що покриває витрати на реєстрацію та проживання.
-Класно! Але я не можу приїхати :( -Тоді подавайся на віртуальну участь ;)
Якщо таки їдете, зробіть фото! Вам не складно – нам приємно 🤗
Учасниця спільноти Геноміка ЮА шукає помічника/помічницю у найбіоінформатичному українському науковому проєкті. Оце так шанс розширити свій біоінформатичний toolkit😲
📢 We’re Hiring! MSc in Bioinformatics
Systems Biology Group at IMBG, Kyiv is looking for a Master student 🧠, who would work on creating robust and automated pangenome-driven pipeline for prokaryotic genomes annotation 🧬. The pipeline aims to be fast and scalable, thus being able to process thousands of assembled genomes for a reasonable amount of time. The pangenome-centric annotation would require research on efficient data structures and graph architecture (e.g. gene-centric vs de Bruijn graph of k-mers). The project is supposed to be conducted as part of Master thesis 🔬 (Bachelor is still possible, but you should allocate enough time and meet the requirements).
Геноміка ЮА запрошує на літню школу Computational Research Advances in Biomedical Sciences (CRABS)!
Цю школу організують наші друзі з Київської школи економіки та ГО “ГМО”. Учасники школи візьмуть участь в біоінформатичних воркшопах та відвідають лекції від представників факультету, куди запрошені дослідники з різних університетів ЄС та США. Після загальної програми, учасники зможуть обрати спеціалізований трек й розвивати свої навички в одному з напрямів: (1) Omics data analysis; (2) Structural bioinformatics & drug development; (3) Bioinformatics for disease research and diagnostics. Слідкуйте за новинами на сайті, оскільки далі будуть анонсовані нові треки. Окрім навичок, учасники, які успішно виконають програму школи, отримають сертифікат з 3 ECTS від КШЕ.
Сподіваємося побачити багато учасників спільноти Геноміки ЮА на заході!
Коли: 10-17 серпня 2025 Де: Київ, оффлайн Деталі та реєстрація: https://crabs.kse.ua до 2025-04-15
– – –
Дисклеймер: ми публікуємо цю можливість на безоплатній основі як інформаційні партнери заходу.
Реєстрацію на курс завершено і щойно усім, хто заповнив анкету реєстрації, був надісланий лист щодо статусу зарахування на курс й доступу до просторів курсу.
Якщо ви реєструвалися, але не отримали листа – щось пішло не так. Напишіть на team-genomics@genomics.org.ua.
Усі подальші оголошення під час курсу будуть відбуватися в Google Workspace. Побачимося 13-го січня!
Давайте поговоримо про deep tech стартапи і те, як їх будувати.
Більшість стартапів адаптують існуючі технології для вирішення існуючих проблем. Але є проблеми, які неможливо вирішити існуючими технологіями. Відповідно деякі компанії сфокусовані навколо розробки нових технологій задля розв’язання проблем, які поки ніхто не може вирішити. Це довгий та високоризиковий процес, що визначає всі інші аспекти побудови та розвитку таких компаній від підбору персоналу до пошуку інвестицій.
🤝Я Алекс, співзасновник і колишній технічний директор deep tech стартапу HTuO Biosciences і я хочу розповісти про певні принципи й прийоми, які на мою думку, корисні при побудові deep tech стартапів.
🎄Буду радий бачити вас на нашій зустрічі наступного року, а поки що бажаю вам веселих свят!
На початку 2025 року наша команда проведе новий освітній курс. Цей курс є частиною великої програми LifeSciencesCourse, яку профінансували DAAD, і яку координують наші колеги з кафедри біохімії та біотехнології ПНУ та Universität Tübingen.
Цей практичний онлайн-курс є продовженням напрямку, який ми викладали у 24-му році на цій ініціативі (транскриптоміка). На цей раз ми сфокусуємося на більш просунутих методах й аналізі їх даних, а саме: транскриптоміка поодиноких клітин (single-cell RNA-sequencing), просторова біологія (spatial biology / transcriptomics) та мультиоміка. На курсі будуть два модулі: перший для тих, хто хотів би опанувати R для аналізу біологічних (і не тільки) даних; другий по біоінформатичному аналізу даних. Оскільки курс буде практичним, від учасників очікується проходження матеріалу паралельно з інструкторами. Інструктори представлені як командою Геноміки ЮА, так і запрошеними фахівцями з академії та індустрії України, ЄС та США.
Курс орієнтований на студентів та аспірантів, хоча участь з інших кар’єрних рівнів не обмежується. Попереднього знання або навичок в R або в темах, які описані вище, не потребується; успішне завершення курсу можливо завдяки опрацюванню матеріалів та порад, отриманих під час курсу. За успішне проходження* курсу учасники можуть отримати наступні сертифікати:
Від LifeScienceCourse на 2 ECTS;
Від Геноміки ЮА за проходження тестування модуля 2 на 70%+;
Від Геноміки ЮА за виконання опціонального групового курсового проєкту.
* успішне проходження передбачає активну участь на курсі та успішне і вчасне проходження тестування. Просто присутність без активності не є критерієм проходження курсу. Критерії для сертифіката LifeSciencesCourse ви можете подивитися на їх сайті під час реєстрації на курс.
Завдяки фінансуванню DAAD, 18 студентів або аспірантів, які постраждали в наслідок війни й успішно пройдуть курс, можуть отримати стипендії по €400. Деталі про стипендії також можна почитати при реєстрації.
Ми запрошуємо усіх охочих реєструватися на курс й бажаємо успішного кар’єрного розвитку у 2025-му році.
Студенти-початківці в біоінформатиці мають нагоду здобути навички в програмуванні та аналізі біологічних даних, отримати навчальний кредит та фінансову підтримку з огляду на скрутне становище через війну.
Практичний курс з біології поодиноких клітин (2021)
Короткий курс є серією онлайн-подій, які висвітлюють теоретичні основи аналізу поодиноких клітин. Програма охоплює підготовку зразків, обробку даних і семінари з різних пайплайнів, включаючи scRNAseq, scATACseq, секвенування TCR/BCR, CITEseq та багато іншого.
Буває, очі розбігаються від кількості туторіалів в інтернеті! А буває, навчального матеріалу не вистачає… Члени Геноміка ЮА підтримують зростаюче покоління біоінформатиків і радо діляться навичками із колегами.
Біоінформатика блискавично поповнюється новими методами й напрямками досліджень. Наша спільнота слідкує за актуальними темами через спілкування із запрошеними фахівцями з передових областей.
Чітке визначення ключових понять є основою взаєморозуміння й ефективної співпраці. Кожен може долучитися до впровадження найвлучніших українських відповідників до біоінформатичних термінів.
To provide the best experiences, we use technologies like cookies to store and/or access device information. Consenting to these technologies will allow us to process data such as browsing behavior or unique IDs on this site. Not consenting or withdrawing consent, may adversely affect certain features and functions.
Functional
Always active
The technical storage or access is strictly necessary for the legitimate purpose of enabling the use of a specific service explicitly requested by the subscriber or user, or for the sole purpose of carrying out the transmission of a communication over an electronic communications network.
Preferences
The technical storage or access is necessary for the legitimate purpose of storing preferences that are not requested by the subscriber or user.
Statistics
The technical storage or access that is used exclusively for statistical purposes.The technical storage or access that is used exclusively for anonymous statistical purposes. Without a subpoena, voluntary compliance on the part of your Internet Service Provider, or additional records from a third party, information stored or retrieved for this purpose alone cannot usually be used to identify you.
Marketing
The technical storage or access is required to create user profiles to send advertising, or to track the user on a website or across several websites for similar marketing purposes.
