Сьогодні перший день курсу з РНК-секвенування, під час реєстрації на який спільнота Геноміки зібрала 36797.64 грн для БФ “Повернись живим”!
Ми вирішили перевести фонду цю частину вже сьогодні, щоб ці кошти працювали на нашу перемогу. Але залишаємо активною банку:
https://send.monobank.ua/jar/6aaDHfuuG8
Якщо вам особливо сподобалася певна зустріч під час п’яти тижнів курсу – ви знаєте, куди перевести свої декілька гривень ;). Те, що нам разом вдасться добрати, переведемо наприкінці курсу.
Друзі, а знаєте, що ми робимо? Ми з радістю анонсуємо, що команда Геноміки приєдналася до ініціативи “Школа успіху. Костянтинівка”!🥳
🧬 Цей проєкт пропонує діалог між учнями шкіл і фахівцями з біології та пов’язаних з нею напрямів. У “Школі” ви зустрінете трьох учасників нашої команди:
📍 Валерія розповість про досвід навчання на біологічній спеціальності в Україні;
📍 Владислав поділиться досвідом застосування біоінформатики в наукових біомедичних проєктах;
📍 Юлія поділиться досвідом кар’єри в біології та біоінформатиці у США та Європі.
📣 Ми будемо дуже вдячні, якщо ви допоможете популяризувати цей захід. Для цього запросіть на заходи “Школи” знайомих учнів, які планують будувати кар’єру в біомедичних напрямках. А якщо ви самі маєте якісь питання на цьому етапі, то надішліть їх нам і ми спробуємо їх обговорити.
🔎 Деталі онлайн-заходу та реєстрація за посиланням:
https://www.facebook.com/events/1032688914205020.
Всім привіт✌️
У нас тут знову намічається зустріч!
💻 Запрошуємо усіх на вебінар, де ми обговоримо теорію статичної візуалізації даних та розглянемо практичні приклади на мовах програмування R та Python.
📝 План заходу:
1. Теорія та практика;
2. Бібліотеки Python: matplotlib та seaborn;
3. Бібліотека R: ggplot2.
🧑🏫 Лектори:
Марина Коршевнюк — PhD candidate, University Medical Center Groningen.
Дмитро Казанжи — Data analyst, National Health Service of Ukraine.
Олександр Петренко — PhD Student, Ludwig Boltzmann Institute for Rare and Undiagnosed Diseases.
📅 Коли: 22 липня 2021, 19:00 (Київ)
🌎Де: Zoom
(https://us02web.zoom.us/j/82769997848?pwd=ZkdhUEtBQzB3M3puVlhHcHBBTFdGQT09)
🗓Додати до календаря: https://calendar.google.com/event?action=TEMPLATE&tmeid=MGo3ZWFndXNodWw5YjRpbGtxMjVkZ3Njam0gZ2Vub21pY3N1YS5vcmdAbQ&tmsrc=genomicsua.org%40gmail.com
З чого почати вивчення біоінформатики?
Аби допомогти початківцям та студентам розпочати вивчення біоінформатики, ми узагальнили наш досвід та рекомендації у Roadmap до біоінформатики. Тут ви можете вибрати будь-який шлях та розпочати вивчати основні теми, необхідні для успіху в аналізі біологічних даних.
Якщо ви хочете адаптувати для себе цей постер, сміливо копіюйте та редагуйте його версію draw.io.
А якщо ви досвідчений біоінформатик, ми будемо надзвичайно раді вашому внеску у вдосконалення та завершення цієї візуалізації!
Single-cell analysis is an extremely powerful tool to discover biological processes due to its high resolution and wide range of possibilities. So we decided to organize a short but in-depth course in this field. We would like to invite you to our practical course in single-cell biology to become familiar with core single-cell analysis methods.
This course is a series of online events that highlight the theoretical basics of single-cell analysis. The program covers sample preparation, data processing, and workshops on different pipelines, including scRNAseq, scATACseq, TCR/BCR sequencing, CITEseq, and much more.
Meeting days are:
Each meeting starts at 18.00 CET and will take approximately 2-3 hours. The format of the event is Zoom-meeting with breakout-rooms if needed. All participants will be supplied with individual tasks, study materials, and instructions for hands-on sessions.
Speakers:
Requirements:
Language: English
Registration:
To register for the course in single-cell biology, please complete the following form: https://forms.gle/H3zXb1ofaSvZ3bKg8
The deadline for registration is 31.03.2021.
Detailed programs will be announced one week before the event. All participants will receive the mail with further instructions and study materials.
Мабуть, кожному відомо, що в 21 сторіччі важливі відкриття відбуваються у дисциплінах, які є на межі двох, або більше наук. Прикладом такої є біоінформатика, де біологічні дані обробляються комп’ютерними алгоритмами і дають відповіді на загадки природи. У новачків, що зацікавились біоінформатикою, виникає питання: “А що треба знати, щоб стати біоінформатиком?”
Саме тому ми вирішили зібрати курси та ресурси, які допоможуть вам на цьому шляху. Напевно, треба починати з розуміння роботи в операційних системах сімейства Linux та програмування на мові R, але не забувайте читати цікаві статті та пробувати використовувати на практиці отримані знання.
Якщо ви рекомендуєте якийсь курс, напишіть t.me/kazanzhy або залиште коментар в Google-документі. Команда “Геноміка ЮА” буде дуже вдячна за допомогу. Щоб переглянути у більш зручному вигляді перейдіть за посиланням на Google-документ.
https://docs.google.com/document/d/1XuSB8qApfOfb3625Lhg4C3TzCpsAWtoSwngypjIlYXU/edit?usp=sharing
У вересні відбулись два семінара по введенню в машинне навчання від Jenya Sidyakin та про основи бібліотеки Pandas від Dmytro Kazanzhy.
Лекція Rostyslav Kuzyakiv (clinical data scientist в Zurich Hospital) про те що як обробляти біомедичні дані.
Вебінар присвячений biomedical data life cycle management, про те які виклики зараз стоять перед аналітиками біомедичних даних та які є доступні open source рішення.
Ця тема напряму пов’язана з біологами, медиками та усіма хто залучений у сучасні наукові проєкти. В презентації буде висвітлений досвід роботи у наукових дослідженнях з боку BioMed Data Life Cycle.
Прикладом для кращого висвітлення теми буде портал Університету Цюриха для Data management, аналізу і візуалізації.
А наприкінці трохи про самоосвіту в Data management та Bioinformatics data analysis, найпоширеніші інструменти та методики.
Приємного перегляду!
Там ми розповіли аудиторії лікарів та медичних менеджерів про біоінформатику у світі та в Україні. Показали, як біоінформатика використовується у клінічній діагностиці та наукових дослідженнях рідкісних хвороб. 💊
Надзвичайно приємно бачити, що ця тема привертає все більше інтересу в Україні! Будемо ради використати компетенцію команди ГО “Геноміка ЮА” та залучити нашу спільноту у разі спільних проєктів з медичними установами. 🧪
Дякуємо учасникам заходу за участь та організаторам за запрошення! 🧬
Світ змінюється, а разом з ним змінюємося й ми!
Ми розпочинали діяльність “Геноміки” ще у 2018-му. Нашим першим заходом був воркшоп з диференційної експресії генів🧬, який в Одесі провела Юлія Ситнікова. Після цього заходу розпочав працювати одеський клуб біоінформатики, а згодом був заснований і київський.
Аби наші зустрічі були безпечними😷, під час пандемії ми зустрічалися виключно онлайн. Такий формат згуртував нашу спільноту ще сильніше, а також дозволив знайти нових колег, які зараз працюють не в Україні. Ми вирішили сконцентруватися саме на такому форматі й надалі. І хоча ми плануємо робити офлайн зустрічі, коли це буде безпечно, ми вирішили не локалізовувати наші клуби, а розширити географію і бути глобальними!🌍
Тому відсьогодні ми об’єднуємо проєкти Odesa Bioinforamtics Club та Kyiv Bioinformatics Club у новий — Bioinformatics UA. Подальше спілкування з обох проєктів буде тут: t.me/bioinformaticsua (колишній чат київського клубу).
Дякуємо, що ви з нами🤩. Сьогодні разом ми робимо найбільшу українську спільноту з біоінформатики, системної біології та пов’язаних напрямів.