GENOMICS UA | Геноміка ЮА

Category: Архів

  • ATAC-me і перепрограмування клітин

    ATAC-me і перепрограмування клітин

    Biomedical Journal Club – це проєкт громадської організації “Геноміка ЮА”. Під час журнального клубу один учасник доповідає про обрану наукову статтю, а слухачі можуть ставити запитання. Після презентації відбувається неформальне спілкування та нетворкінг.

    + На цій зустрічі ми обговоримо статтю:
    Barnett K.R. et al. ATAC-Me Captures Prolonged DNA Methylation of Dynamic Chromatin Accessibility Loci during Cell Fate Transitions
    https://www.cell.com/molec…/fulltext/S1097-2765(20)30004-6
    + Доповідач: Іван Берест, PhD студент в European Molecular Biology Laboratory, біоінформатик (https://twitter.com/jambocurious).
    + Коли: 22 квітня 2020 о 19:00 (київський час).
    + Де: онлайн. Ми робимо дзвінок-конференцію в Zoom, до якого може приєднатися кожен. Там доповідач транслює презентацію, можна ставити питання та брати участь у дискусії. Якщо в вас немає змоги приєднатися через Zoom, ми робимо трансляцію (крім неформальної частини та нетворкінгу) на нашому YouTube-каналі.
    Zoom: https://us02web.zoom.us/j/84990970614… | Meeting ID: 849 9097 0614 | Password: genomicsua
    YouTube: https://youtu.be/Jc0g3EuXSBU

    FAQ:
    — Що таке журнальний клуб?
    — Це формат, який працює в багатьох інститутах та лабораторіях по всьому світу: доповідач презентує статтю та додаткову інформацію, необхідну для її розуміння, аналізує експериментальну частину, переваги та недоліки. Після цього учасники зустрічі оговорюють статтю. Взагалі, це гарний спосіб навчитися новому, дізнатися про інші напрями, познайомитися з новими людьми.

    — Як мені підготуватися для зустрічі?
    — Дуже рекомендується прочитати саму статтю та подивитися ілюстрації. Це допоможе визначити запитання та теми для дискусії. Якщо тема для вас є новою чи складною, рекомендовано ознайомитися з базовими поняттями. Якщо вам потрібна рекомендація, що прочитати на певну тему, запитайте нас!

    — Як мені приєднатися та ставити запитання?
    — Вам потрібно зареєструватися на zoom.com (це безкоштовно), звантажити програму, перейти по посиланню, яке надане в анонсі події та ввести приведений пароль. Чи просто ввести meeting ID та пароль, якщо ви вже встановили та відкрили програму. Якщо є змога, приєднуйтесь з веб-камерою, це допомагає створити ефект присутності задля більш неформального спілкування. Зазвичай учасники виключають мікрофон (“mute”), доки спілкується хтось інший. Якщо в вас виникли запитання до завершення доповіді, ви можете надіслати їх в чат, чи запитати через мікрофон. Якщо ви дивитесь нас через YouTube, ви можете залишати запитання в чаті трансляції.

    — Мені сподобалось / є запитання / хочу бути на зв’язку з вами.
    — Перш за все, дякуємо за вашу зацікавленість! Ми зібрали біомедичну спільноту в Telegram і ви можете приєднатися. Перейдіть на канал https://t.me/GenomicsUA, підпишіться і в описі ви знайдете посилання на чат.
    Не забудьте підписатися на нашу сторінку Facebook:
    https://www.facebook.com/GenomicsUA
    На наш YouTube-канал:
    https://www.youtube.com/ngogenomicsua
    Та на локальне представництво організації:
    Київ: https://www.facebook.com/kyivbioinformatics/
    Одеса: https://www.facebook.com/odesabioinformatics/
    В разі запитань, зв’яжіться з нами будь-яким з цих способів.

    подивитися запис
  • Бактеріальні нуклеотиди та метод рідинної хроматографії

    Бактеріальні нуклеотиди та метод рідинної хроматографії

    Відкриті лекції від ГО “Геноміка ЮА” — це формат, в якому запрошені фахівці розповідають про свій проєкт, чи про науковий напрям, а слухачі можуть ставити запитання. Після презентації відбувається неформальне спілкування та нетворкінг.

    + Темою цієї лекції стане вивчення бактеріальних нуклеотидів за допомогою методу високоефективної рідинної хроматографії (ВРХ). На зустрічі лекторка представить статтю про застосування методу ВРХ в сучасних наукових дослідженнях та розповість про базові принципи роботи з хроматографом.
    Посилання на статтю:
    https://www.nature.com/articles/s41598-017-10988-6
    + Доповідачка: Tatyana Brodiazhenko, PhD-студентка в University of Tartu (Estonia) і assistant researcher в Umeå University (Sweden).
    + Коли: 30.04.2020 о 19:00 (за київським часом).
    + Де: онлайн. Ми робимо дзвінок-конференцію в Zoom, до якого може приєднатися кожен. Там доповідач транслює презентацію, можна ставити питання та брати участь у дискусії. Якщо в вас немає змоги приєднатися через Zoom, ми робимо трансляцію (крім неформальної частини та нетворкінгу) на нашому YouTube-каналі.
    Zoom: Meeting ID: 828 8853 5621, Password: genomicsua
    https://us02web.zoom.us/j/82888535621?pwd=S1BSMmxLK1F0UHFzRGEzMUhBajFnUT09
    YouTube: https://youtu.be/A3N1lkSQV4I

    FAQ:
    — Як мені приєднатися та ставити запитання?
    — Вам потрібно зареєструватися на zoom.com (це безкоштовно), звантажити програму, перейти по посиланню, яке надане в анонсі події та ввести приведений пароль. Чи просто ввести meeting ID та пароль, якщо ви вже встановили та відкрили програму. Якщо є змога, приєднуйтесь з веб-камерою, це допомагає створити ефект присутності задля більш неформального спілкування. Зазвичай учасники виключають мікрофон (“mute”), доки спілкується хтось інший. Якщо в вас виникли запитання до завершення доповіді, ви можете надіслати їх в чат, чи запитати через мікрофон. Якщо ви дивитесь нас через YouTube, ви можете залишати запитання в чаті трансляції.— Мені сподобалось / є запитання / хочу бути на зв’язку з вами.
    — Перш за все, дякуємо за вашу зацікавленість! Ми зібрали біомедичну спільноту в Telegram і ви можете приєднатися. Перейдіть на канал https://t.me/GenomicsUA, підпишіться і в описі ви знайдете посилання на чат.
    Не забудьте підписатися на наші сторінки Facebook:
    https://www.facebook.com/GenomicsUA
    https://www.facebook.com/BioinformaticsUA
    На наш YouTube-канал:
    https://www.youtube.com/ngogenomicsua
    В разі запитань, зв’яжіться з нами будь-яким з цих способів.

    подивитися запис

  • Регуляція структури хроматину транспозонами

    Запрошуємо вас на онлайн-зустріч біомедичного журнального клубу, де разом з Valeria Vasylyeva розберемось, як транспозони підтримують структуру хроматину.
    Рекомендуємо ознайомитися зі статтею для плідної дискусії.
    Стаття: https://genomebiology.biomedcentral.com/…/s13059-019…
    Де: online.
    Є можливість приєднатися до онлайн-конференції в Zoom, щоб мати змогу поспілкуватися зі спікеркою та брати участь у дискусії, чи дивитися трансляцію на Youtube.
    Коли: 11 квітня 2020, 19:00 – 21:00 за київським часом.

    Як приєднатися до зустрічі журнального клубу:

    1. Якщо ви бажаєте взяти участь у дискусії, ставити запитання, поспілкуватися зі спікеркою, то підключайтеся через Zoom (zoom.com, реєстрація та використання безкоштовні). Запитання можна буде писати в чаті, чи задати особисто після докладу.
    Лінк заходу: https://us02web.zoom.us/j/112073341…
    Meeting ID: 112 073 341
    Password: genomicsua

    2. Якщо ви не можете приєднатися через Zoom, є можливість дивитися трансляцію на Youtube. Можна писати запитання в чаті трансляції, проте пріоритет буде за запитаннями з Zoom.
    https://youtu.be/wsdIg0wnVq8

    Якщо вам потрібна допомога з налаштуванням, дайте знати нам через приватні повідомлення сторінки https://www.facebook.com/GenomicsUA, ибо через телеграм-чат каналу t.me/GenomicsUA.

    подивитися захід

  • Introduction to single-cell sequencing

    Introduction to single-cell sequencing

    We want to invite you to visit open lectures “Introduction to single-cell sequencing” of the Kyiv Bioinformatics Club.
    During the two meetings, we will talk about how the single-cell technologies were invented, how they were evolved and how to determine the DNA / RNA sequences of each individual cell.

    Lecturer: Maryna Korshevniuk, a student at the Max Delbrück Center for Molecular Medicine in the Helmholtz Association.
    Her interests: single-cell technologies, multi-omics.

    When: February 10th and 11th, 2020 from 7:00 PM
    Where: Bohomolets Institute of Physiology, Main Building, Second Floor, room 212.
    Address: 4, Bogomolets Street, Kyiv

    IMPORTANT UPDATE: All lectures will be conducted in English.

    подивитися запис
  • Трансляційні дослідження

    Трансляційні дослідження

    Запрошуємо вас відвідати відкриту лекцію “Трансляційні дослідження: scientia vincere morbum” від організації Genomics UA.
    Від першої стрічки коду, від першого натискання піпеткою до нового лікування певної хвороби — саме в цьому полягає сила трансляційних досліджень. На лекції ми обговоримо:
    І) що таке трансляційні дослідження;
    ІІ) приклади, коли вони призвели до позитивних наслідків для пацієнтів та для суспільства;
    ІІІ) хто працює над ними та чим ці люди займаються;
    ІV) які кар’єрні можливості існують в цьому напрямі.

    Для кого: в лекції буде використовуватися наукова термінологія, яка знайома студентам та спеціалістам біомедичних напрямів, проте лекція орієнтована на широку аудиторію і буде зрозуміла всім, хто цікавиться чи працює у life sciences.
    Лектор: Oleksandr Petrenko, лікар, PhD-студент в Ludwig Boltzmann Institute for Rare and Undiagnosed Diseases та Predoctoral Fellow у CeMM (Research Center for Molecular Medicine of the Austrian Academy of Sciences), співзасновник громадської організації “Геноміка ЮА”, автор блогу mutation.me – biomedicine 4U.

    Коли: 14 лютого, 17:00 – 19:00.
    Де: Одеська обласна універсальна наукова бібліотека ім. М.Грушевського, другий поверх. https://goo.gl/maps/oRJXC6KSpuauGnG28.
    Вхід: безкоштовний.

    Оригінал зображення: “Metastatic Melanoma Cells”, Julio C. Valencia, NCI Center for Cancer Research, ліцензія CC BY-NC 2.0

  • Зустріч з нанопорного секвенування

    Зустріч з нанопорного секвенування

    Запрошуємо Вас на зустріч Київського біоінформатичного клубу.
    Де: пр. Перемоги, 37, бібліотека КПІ, зала 1.2
    Коли: 8 лютого, о 12:00.

    План заходу:
    1. Оглядова лекція про технологію нанопорного секвенування, прилади сімейства Oxford Nanopore, плюси та мінуси секвенування третього покоління.
    Лектор: Dmytro Kazanzhy, дата-аналітик.

    2. Кейс аналізу даних нанопорного секвенування з використанням хмарних сервісів (Google Cloud Platform).
    Проект стосувався визначення мікроорганізмів та їх асоціації, що викликають сепсис у реанімаційних хворих.
    Лектор: Severyn Parkhomenko, інженер-програміст, data scientist в The APP Solutions.

    3. Нетворкінг
    Ми б дуже хотіли, щоб кожен з вас поділився своїми вміннями та інтересами. Це допоможе знайти однодумців для майбутніх проектів. Кожному надається 3-5 хвилин для розповіді + 2 хвилини на запитання аудиторії. Можна з презентацією.
    Лектор – кожен з Вас.

  • Ландшафт поодиноких клітин при патології раку молочної залози

    Ландшафт поодиноких клітин при патології раку молочної залози

    На зустрічі біомедичного журнального клубу ми обговоримо статтю:
    𝗧𝗵𝗲 𝘀𝗶𝗻𝗴𝗹𝗲-𝗰𝗲𝗹𝗹 𝗽𝗮𝘁𝗵𝗼𝗹𝗼𝗴𝘆 𝗹𝗮𝗻𝗱𝘀𝗰𝗮𝗽𝗲 𝗼𝗳 𝗯𝗿𝗲𝗮𝘀𝘁 𝗰𝗮𝗻𝗰𝗲𝗿
    (https://www.nature.com/articles/s41586-019-1876-x)

    Презентацію по статті підготовить Maryna Korshevniuk – студентка в Max Delbrück Center for Molecular Medicine in the Helmholtz Association. В сферу інтересів лекторки входить 𝘚𝘪𝘯𝘨𝘭𝘦-𝘤𝘦𝘭𝘭 𝘵𝘦𝘤𝘩𝘯𝘰𝘭𝘰𝘨𝘪𝘦𝘴 та мультиоміка.

    Коли: 2 лютого 2020 о 20:00
    Де: online, https://www.youtube.com/watch?v=9_qzQ7uuTQ0

    подивитися запис
  • Comparative cross-species transcriptomics for lifespan

    Comparative cross-species transcriptomics for lifespan

    Відео лекції Comparative cross-species transcriptomics for lifespan, яку нещодавно прочитав Ursu Eugen з Institute of Biochemistry of the Romanian Academy.

    Приємного перегляду!

    подивитися запис

  • Сучасна біотехнологія і фарміндустрія

    Сучасна біотехнологія і фарміндустрія

    Запис вебінару з кар’єрних можливостей у сфері біотехнологій та фармацевтичній індустрії.

    Лектор: Юлія Ситнікова

    Приємного перегляду!

    подивитися запис
  • Kyiv Bioinformatics Club Meeting

    Kyiv Bioinformatics Club Meeting

    Біоінформатичний клуб — це спільнота для навчання біоінформатиці, створення проектів та спілкування. Ми запрошуємо приєднатися до зустрічі для створення спільноти в Києві всіх, кому цікава біоінформатика, хто працює в цьому напрямку або бажає дізнатися більше.

    Під час першої зустрічі на вас чекають три лекції та нетворкінг. Деталі щодо програми можна дізнатися за посиланням:
    http://bit.ly/2WJh1k5

    Коли: 18 травня, 14:00 — 18:00
    Де: 12 зала Бібліотека КПІ / KPI Library на проспекті Перемоги 37, станція метро “Політехнічний інститут” (http://bit.ly/2WN1Jet)
    Вхід: безкоштовний за умови реєстрації (https://forms.gle/a4czwWfq4x6NPAen8)