Category: Архів

Даний захід відбудеться завдяки організаційній підтримці Олени Мельник, учасниці спільноти “Геноміка ЮА”.
Лекція буде присвячена еволюційній біології, а саме взаємодії навколишнього середовища та організму.
❓Як живі організми стали такими, якими ми їх знаємо сьогодні?
❓Як функції та фенотипи змінюються з часом?
❓Як зміни генотипу впливають на пристосованість?
❓Як у всьому Цьому допомагає обчислювальна біологія?
Усі ці питання будуть розглянуті під час лекції.
👨‍🏫 Лектор: професор Федір Кондрашов, IST Austria.
📅 Дата: 28.01.2021, початок о 18:00 (київський час).
🌎 Де: Zoom, дані для підключення (https://us02web.zoom.us/j/88498182724?pwd=bTFnaWJNejZkemNLbnR0aXQrYkpwQT09):
Лекція буде проводитися російською мовою і, за необхідності, організатори допоможуть з перекладом під час сесії «питання-відповідь».

Single-cell analysis is an extremely powerful tool to discover biological processes due to its high resolution and wide range of possibilities. So we decided to organize a short but in-depth course in this field. We would like to invite you to our practical course in single-cell biology to become familiar with core single-cell analysis methods.
This course is a series of online events that highlight the theoretical basics of single-cell analysis. The program covers sample preparation, data processing, and workshops on different pipelines, including scRNAseq, scATACseq, TCR/BCR sequencing, CITEseq, and much more.

Meeting days are:

• Sunday, 4.04.2021
• Monday, 5.04.2021
• Wednesday, 7.04.2021
• Friday, 9.04.2021
• Saturday, 10.04.2021

Each meeting starts at 18.00 CET and will take approximately 2-3 hours. The format of the event is Zoom-meeting with breakout-rooms if needed. All participants will be supplied with individual tasks, study materials, and instructions for hands-on sessions.

Speakers:

• Vladyslav Kavaka, MD candidate, LMU Munich
• Maryna Korshevniuk, PhD Candidate, UMCG
• Oleksandr Petrenko, Predoctoral Fellow, LBI-RUD / CeMM
• Yuliya Syntikova, PhD, LifeMine Therapeutics

Requirements:

• Basic knowledge in cell and molecular biology;
• Basic skills in R programming language;
• No prior knowledge of single-cell analysis is required.

Language: English

Registration:
To register for the course in single-cell biology, please complete the following form: https://forms.gle/H3zXb1ofaSvZ3bKg8
The deadline for registration is 31.03.2021.
Detailed programs will be announced one week before the event. All participants will receive the mail with further instructions and study materials.

Запрошуємо всіх бажаючих до нетворкінгу з учасниками NextStep Science (http://nextstepscience.org/) — громадської організації, що організовує нетворкінг-івенти та кар’єрні заходи для студентів і випускників природничих наук.

Ми почнемо з невеличкого “квізу” на платформі Sli.do, щоб зрозуміти чим хто займається та які теми цікавлять аудиторію події.
Потім в ми розділимось на кімнати по 2-3 людини, де у кожного буде 5 хвилин на те щоб поспілкуватись і познайомитися один з одним. Ця процедура буде повторена тричі.
Після цього ми розділимось на ~2 окремі кімнати, де будемо обговорювати наперед підготовлену організаторами тему.
А наприкінці події кожен зможе поспілкуватись один з одним в окремих кімнатах.

👨‍🔬👩‍🔬Це чудова нагода познайомитись із новими людьми, які так само захоплені наукою та технологіями.
🇬🇧🖖Офіційні мови спілкування: англійська та клінгонська.
🌎Де: Zoom
(https://zoom.us/j/94145503186)📅Коли: 7 лютого 2021 о 19:00 (UTC+02)
Щоб отримати турботливе нагадування, ось подія в ФБ (https://fb.me/e/USSZA6fv).

Даний захід відбудеться завдяки організаційній підтримці Олени Мельник, учасниці спільноти “Геноміка ЮА”.

Кожен новонароджений має близько ста нових мутацій, з яких приблизно десять — шкідливі.
❓Наскільки пристосованість людини через це знижена?
❓Чи слід чекати накопичення шкідливих алелів у популяціях, що живуть у шкідливих умовах?
❓Чи буде користь від редагування генотипів?
Усі ці питання будуть розглянуті під час лекції.

👨‍🏫 Лектор: професор Олексій Кондрашов, Університет Мічигану, США.
📅 Дата: 11.01.2021, початок о 18:00 (київський час).
🌎 Де: Zoom, дані для підключення доступні після реєстрації: https://us02web.zoom.us/meeting/register/tZ0kcOmvrz0jG9cww20ZCFtkkCALpKwfTWtT
Лекція читатиметься російською мовою, та за необхідності організатори допоможуть з перекладом під час сесії «питання-відповідь».

Зображення заходу використовує знімок Кліффа з Арлінгтона, штат Вірджинія, США, опублікований під ліцензією Creative Commons Attribution 2.0 Generic (https://www.flickr.com/people/28567825@N03).

Біоінформатика існує, щоб знаходити відповіді на біологічні питання, котрі неможливо розв’язати лабораторними методами. Одне з таких питань — точне визначення фенотипових різниць у біологічних зразках. Як виокремити пацієнтів, котрим допоможуть нові ліки? Як клітини реагують на подразник або на гормон? Які метаболічні шляхи активуються при загоєнні ран?

Відповідями на ці питання займається транскриптоміка та її базові методи: Differential Gene Expression та Gene Set Enrichment Analysis. Цими методами ми можемо отримати різницю між обраними фенотипами за результатами їх РНК-секвенування. На лекції ви зможете більше дізнатися про те, як правильно аналізувати дані генної експресії для визначення диференційної експресії.

Лектор: Олександр Шинкаренко, співзасновник HTuO Biosciences, співзасновник Genomics UA.
Дата: 26.12.2020
Час: 20:00 (по Києву)
Де: Zoom (https://us02web.zoom.us/j/83799185308?pwd=RDVYekcyK1paZUpkTkpMRVlqc29odz09)

Ось і настали часи, коли шляхи мистецтва та науки перетнулися!

Nanobot Medical Animation Inc. — це компанія, що розробляє мультімедіа для візуалізації складних біологічних процесів. Nanobot Medical працюють у напрямках 3D анімації, ілюстрацій, доповненої та віртуальної реальності. Їх продукт затребуваний для освітніх програм і реклами у фармацевтичній, біотехнологічній галузях та в індустрії медичних пристроїв.

Наш гість: Андрій Конюх, CEO Nanobot Medical

Розповідатиме про принципи роботи в галузі біомед анімації, чого можна досягнути на міжнародному рівні на прикладі Студії, та що робити тому, хто хоче спробувати себе як біомед-художника.

Коли: 1 липня, 19:00
Ви можете поспілкуватися безпосередньо із гостем у
Zoom https://us02web.zoom.us/j/8511143843?pwd=dk5ubkx6Z001US9JV281ZWtCSXFjdz09
Ідентифікатор: 851 114 3843
Пароль: 7AEZ7K
або задати питанні в чаті на трансляції YouTube
https://www.youtube.com/watch?v=94fQbOT5gyw&feature=youtu.be

Зображення взяті з https://nanobotmedical.com/

The topic of the lecture: From patients to genetics – paralyzing struggles of translating ALS
Speaker: Sophie Imhof, PhD Student at the Medical University of Vienna, Department of Neurology, author of a blog for science communication: https://www.instagram.com/sophie_imhof/
When: 05.06.2020 at 18:00 (Vienna time) | 19:00 (Kyiv time).
Where: Online. We invite you to connect via Zoom to participate in the discussion after the lecture, or to join the YouTube translation. The access links will be provided after free registration: https://www.eventbrite.com/e/105936210056

Open lectures of the NGO “Genomics UA” ​​is a non-formal education format in which invited experts talk about their projects or research field. After a presentation, we organize a Q&A session with the speaker and provide an opportunity for informal communication and networking.

Amyotrophic lateral sclerosis is a fast progressing and lethal neurodegenerative disease that predominantly affects the upper and lower motor neurons. To this point, there is no cure for this pathology and patients have a life expectancy of 3 months to 5 years. Only 10% of cases are due to genetic and hereditary reasons (familial ALS), leaving 90% of patients in the dark of the underlying mechanism of their pathology (sporadic ALS). Only two FDA approved compounds, Riluzole, which prolongs life for up to 3 months, and Edaravone, which was shown to slow down disease progression, are used to treat ALS patients, however, they remain drugs of low efficiency. Out of this reason, researchers worldwide are establishing models and using state-of-the-art technology to investigate this disease. Although our community of ALS scientists and clinicians is eager to beat this pathology, we face many obstacles in the form of patient heterogeneity, different molecular phenotypes, and technical limitations. To overcome these burdens, I believe we need to change our mindset and perspective on this disease and step one step back to discover novel niches of research. Patient cohorts, genetics, iPSCs, stem cell therapy, vitamin supplements – what do we actually know about this disease and how can we pave a new path for effective treatment?

Additional information:
– How can I join and ask questions?
– You need to register on zoom.com (it’s free), download the program, go to the link provided in the event announcement, and enter the password. Or just enter the meeting ID and password if you have already installed and opened the program. If possible, join our meetings with a turned-on camera, it helps to create a presence effect for more informal communication. Participants usually turn off the microphone while someone else is talking. If you have questions before the end, feel free to send them to the chat. If you can not join us via Zoom, there is an alternative to join through the YouTube stream. If you watch us on YouTube, you can ask questions in the chat and our moderators will check them.

– I liked the event / I have more questions / I want to be in touch with you.
– First of all, thank you for your interest! We have put together a biomedical community in Telegram and you are invited to join. Go to the channel https://t.me/GenomicsUA, subscribe, and in the description, you will find a link to the chat. If you are not a Telegram user, feel free to drop your question to i@genomics.org.ua, or to our Facebook page.

Don’t forget to subscribe to our Facebook page:
https://www.facebook.com/GenomicsUA
To our YouTube channel:
https://www.youtube.com/ngogenomicsua
And to the local representative office of the organization:
Kyiv: https://www.facebook.com/kyivbioinformatics/
Odesa: https://www.facebook.com/odesabioinformatics/
If you have any questions, please contact us in any of these ways.

Приємного перегляду!

Відкриті лекції від ГО “Геноміка ЮА” — це формат, в якому запрошені фахівці розповідають про свій проєкт, чи про науковий напрям, а слухачі можуть ставити запитання. Після презентації відбувається неформальне спілкування та нетворкінг.

+ Темою цієї лекції стане вивчення бактеріальних нуклеотидів за допомогою методу високоефективної рідинної хроматографії (ВРХ). На зустрічі лекторка представить статтю про застосування методу ВРХ в сучасних наукових дослідженнях та розповість про базові принципи роботи з хроматографом.
Посилання на статтю:
https://www.nature.com/articles/s41598-017-10988-6
+ Доповідачка: Tatyana Brodiazhenko, PhD-студентка в University of Tartu (Estonia) і assistant researcher в Umeå University (Sweden).
+ Коли: 30.04.2020 о 19:00 (за київським часом).
+ Де: онлайн. Ми робимо дзвінок-конференцію в Zoom, до якого може приєднатися кожен. Там доповідач транслює презентацію, можна ставити питання та брати участь у дискусії. Якщо в вас немає змоги приєднатися через Zoom, ми робимо трансляцію (крім неформальної частини та нетворкінгу) на нашому YouTube-каналі.
Zoom: Meeting ID: 828 8853 5621, Password: genomicsua
https://us02web.zoom.us/j/82888535621?pwd=S1BSMmxLK1F0UHFzRGEzMUhBajFnUT09
YouTube: https://youtu.be/A3N1lkSQV4I

FAQ:
— Як мені приєднатися та ставити запитання?
— Вам потрібно зареєструватися на zoom.com (це безкоштовно), звантажити програму, перейти по посиланню, яке надане в анонсі події та ввести приведений пароль. Чи просто ввести meeting ID та пароль, якщо ви вже встановили та відкрили програму. Якщо є змога, приєднуйтесь з веб-камерою, це допомагає створити ефект присутності задля більш неформального спілкування. Зазвичай учасники виключають мікрофон (“mute”), доки спілкується хтось інший. Якщо в вас виникли запитання до завершення доповіді, ви можете надіслати їх в чат, чи запитати через мікрофон. Якщо ви дивитесь нас через YouTube, ви можете залишати запитання в чаті трансляції.— Мені сподобалось / є запитання / хочу бути на зв’язку з вами.
— Перш за все, дякуємо за вашу зацікавленість! Ми зібрали біомедичну спільноту в Telegram і ви можете приєднатися. Перейдіть на канал https://t.me/GenomicsUA, підпишіться і в описі ви знайдете посилання на чат.
Не забудьте підписатися на наші сторінки Facebook:
https://www.facebook.com/GenomicsUA
https://www.facebook.com/BioinformaticsUA
На наш YouTube-канал:
https://www.youtube.com/ngogenomicsua
В разі запитань, зв’яжіться з нами будь-яким з цих способів.

Запрошуємо вас відвідати відкриту лекцію “Трансляційні дослідження: scientia vincere morbum” від організації Genomics UA.
Від першої стрічки коду, від першого натискання піпеткою до нового лікування певної хвороби — саме в цьому полягає сила трансляційних досліджень. На лекції ми обговоримо:
І) що таке трансляційні дослідження;
ІІ) приклади, коли вони призвели до позитивних наслідків для пацієнтів та для суспільства;
ІІІ) хто працює над ними та чим ці люди займаються;
ІV) які кар’єрні можливості існують в цьому напрямі.

Для кого: в лекції буде використовуватися наукова термінологія, яка знайома студентам та спеціалістам біомедичних напрямів, проте лекція орієнтована на широку аудиторію і буде зрозуміла всім, хто цікавиться чи працює у life sciences.
Лектор: Oleksandr Petrenko, лікар, PhD-студент в Ludwig Boltzmann Institute for Rare and Undiagnosed Diseases та Predoctoral Fellow у CeMM (Research Center for Molecular Medicine of the Austrian Academy of Sciences), співзасновник громадської організації “Геноміка ЮА”, автор блогу mutation.me – biomedicine 4U.

Коли: 14 лютого, 17:00 – 19:00.
Де: Одеська обласна універсальна наукова бібліотека ім. М.Грушевського, другий поверх. https://goo.gl/maps/oRJXC6KSpuauGnG28.
Вхід: безкоштовний.

Оригінал зображення: “Metastatic Melanoma Cells”, Julio C. Valencia, NCI Center for Cancer Research, ліцензія CC BY-NC 2.0

Запрошуємо Вас на зустріч Київського біоінформатичного клубу.
Де: пр. Перемоги, 37, бібліотека КПІ, зала 1.2
Коли: 8 лютого, о 12:00.

План заходу:
1. Оглядова лекція про технологію нанопорного секвенування, прилади сімейства Oxford Nanopore, плюси та мінуси секвенування третього покоління.
Лектор: Dmytro Kazanzhy, дата-аналітик.

2. Кейс аналізу даних нанопорного секвенування з використанням хмарних сервісів (Google Cloud Platform).
Проект стосувався визначення мікроорганізмів та їх асоціації, що викликають сепсис у реанімаційних хворих.
Лектор: Severyn Parkhomenko, інженер-програміст, data scientist в The APP Solutions.

3. Нетворкінг
Ми б дуже хотіли, щоб кожен з вас поділився своїми вміннями та інтересами. Це допоможе знайти однодумців для майбутніх проектів. Кожному надається 3-5 хвилин для розповіді + 2 хвилини на запитання аудиторії. Можна з презентацією.
Лектор – кожен з Вас.