Вебінар: Bioinformatics of small variant calling, annotation, and prioritization


Привіт, друзі. На цю суботу ми запланували вебінар з оглядом біоінформатики малих геномних варіантів.
На зустрічі розглянемо процеси визначення, анотації, та пріоритизації геномних варіантів.
У якості типів даних будуть геноми, екзоми, панелі глибокого покриття, амплікони, секвенування із UMI та подвійні UMI.
А ще поговоримо про безліч інструментів:

  • пайплайни: GATK, Dragen, bcbio,Terra;
  • анотація: snpEff, VEP, OpenCravat, vcfanno;
  • пріоритизація: gemini, R/tidyverse, excel, oncoprints, SolveBio, cBioPortal;

Лектор: Сергій Науменко
Де: онлайн (посилання на Zoom (https://us02web.zoom.us/j/88981733385?pwd=cjN5TnB2QlVleHkvNlp2OFc3a3ZHQT09))
Коли: 14 травня 2022, 17:00 (Київ) / 10:00 (Бостон)